Séance de cours

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

Graph Chat

Chattez avec Graph Search

Posez n’importe quelle question sur les cours, conférences, exercices, recherches, actualités, etc. de l’EPFL ou essayez les exemples de questions ci-dessous.

AVERTISSEMENT : Le chatbot Graph n'est pas programmé pour fournir des réponses explicites ou catégoriques à vos questions. Il transforme plutôt vos questions en demandes API qui sont distribuées aux différents services informatiques officiellement administrés par l'EPFL. Son but est uniquement de collecter et de recommander des références pertinentes à des contenus que vous pouvez explorer pour vous aider à répondre à vos questions.

Dans cours

CH-419: Protein mass spectrometry and proteomics

In systems biology, proteomics represents an essential pillar. The understanding of protein function and regulation provides key information to decipher the complexity of living systems. Proteomic technology now enables deep quantitative proteome mapping v ...

Description

Cette séance de cours couvre les principes fondamentaux de la spectrométrie de masse des protéines et de la protéomique, y compris l'introduction à l'analyse des protéines, les rappels de spectrométrie de masse, les sources d'ionisation, les analyseurs et les détecteurs utilisés en protéomique. Il explore également les stratégies protéomiques, les flux de travail, les techniques de séparation, les flux de travail protéomiques quantitatifs, la bioinformatique protéomique et les applications à la biologie et à la recherche clinique. Le contenu comprend des discussions sur la protéomique ascendante, l'empreinte de masse des peptides, l'identification des protéines à l'aide des données MS / MS et la comparaison entre les méthodes de recherche d'ions PMF et MS / MS.

Enseignant·e

Loïc Dayon

Enseignement et PhD Cours Protein mass spectrometry and proteomics CH-419 L'analyse protéomique est un pilier essentiel de la biologie des systèmes, permettant une meilleure compréhension du vivant. Les technologies protéomiques, et en particulier celles basées sur la spectrométrie de masse, permettent désormais de cartographier les protéomes à large échelle.

Source officielle

Proximité ontologique

Chimie

Chimie analytique: Spectrométrie de masse

Concepts associés (32)

Protéomique

La protéomique désigne la science qui étudie les protéomes, c'est-à-dire l'ensemble des protéines d'une cellule, d'un organite, d'un tissu, d'un organe ou d'un organisme à un moment donné et sous des conditions données. Dans la pratique, la protéomique s'attache à identifier de manière globale les protéines extraites d'une culture cellulaire, d'un tissu ou d'un fluide biologique, leur localisation dans les compartiments cellulaires, leurs éventuelles modifications post-traductionnelles ainsi que leur quantité.

Séquençage des protéines

Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique. Elle est destinée à connaître le nombre, la nature chimique et l'ordre de tous les résidus d'acides aminés dans un polypeptide. Pour cela, si la protéine contient plus d'une chaîne polypeptidique, les chaînes doivent être d'abord séparées, puis purifiées. Généralement, toutes les liaisons disulfures seront réduites et les thiols ainsi obtenus alkylés.

Ion source

An ion source is a device that creates atomic and molecular ions. Ion sources are used to form ions for mass spectrometers, optical emission spectrometers, particle accelerators, ion implanters and ion engines. Electron ionization Electron ionization is widely used in mass spectrometry, particularly for organic molecules. The gas phase reaction producing electron ionization is M{} + e^- -> M^{+\bullet}{} + 2e^- where M is the atom or molecule being ionized, e^- is the electron, and M^{+\bullet} is the resulting ion.

Chromatographie en phase liquide-spectrométrie de masse

La chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse (en anglais Liquid chromatography-mass spectrometry ou LC-MS) est une méthode d'analyse qui combine les performances de la chromatographie en phase liquide et de la spectrométrie de masse afin d'identifier et/ou de quantifier précisément de nombreuses substances. Une unité LC-MS est composée de deux blocs principaux : un chromatographe en phase liquide et un spectromètre de masse. Catégorie:Méthode de la biochimie Catégorie:Chromatogra

Electron ionization

Electron ionization (EI, formerly known as electron impact ionization and electron bombardment ionization) is an ionization method in which energetic electrons interact with solid or gas phase atoms or molecules to produce ions. EI was one of the first ionization techniques developed for mass spectrometry. However, this method is still a popular ionization technique. This technique is considered a hard (high fragmentation) ionization method, since it uses highly energetic electrons to produce ions.

Afficher plus

Séances de cours associées (64)

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

Couvre la spectrométrie de masse des protéines, les techniques de protéomique, les défis et les applications dans l'analyse de mélanges de protéines complexes.

Protéomique et spectrométrie de masse

Explore la spectrométrie de masse des protéines, les techniques de protéomique, la préparation des échantillons, les méthodes de séparation, les flux de travail quantitatifs, la bioinformatique et les applications en biologie.

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

Couvre la spectrométrie de masse des protéines, les principes fondamentaux de la protéomique, les sources d'ionisation, les analyseurs, les détecteurs, la précision de la masse, la résolution et diverses méthodes d'ionisation.

Spectrométrie de masse des protéines Insights

Explore les mécanismes d'éjection des matériaux en spectrométrie de masse MALDI, en mettant l'accent sur les paramètres laser et les propriétés de matrice d'analyte.

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique: Techniques et applications

Explore les techniques de spectrométrie de masse des protéines, y compris les méthodes de marquage, la quantification et la découverte de biomarqueurs.

Afficher plus

Concepts associés (32)

Protéomique

Séquençage des protéines

Ion source

Chromatographie en phase liquide-spectrométrie de masse

Electron ionization

Afficher plus