Séance de cours

Protéomique et spectrométrie de masse

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Dans cours

CH-419: Protein mass spectrometry and proteomics

In systems biology, proteomics represents an essential pillar. The understanding of protein function and regulation provides key information to decipher the complexity of living systems. Proteomic technology now enables deep quantitative proteome mapping v ...

Description

Cette séance de cours couvre les principes et les techniques de la spectrométrie de masse des protéines et de la protéomique, en se concentrant sur les stratégies ascendantes et descendantes, la préparation des échantillons et les techniques de séparation comme l'électrophorèse sur gel et la chromatographie liquide. Il traite également des flux de travail quantitatifs, des outils bioinformatiques et des applications en biologie et en recherche clinique.

Enseignant·e

Loïc Dayon

Enseignement et PhD Cours Protein mass spectrometry and proteomics CH-419 L'analyse protéomique est un pilier essentiel de la biologie des systèmes, permettant une meilleure compréhension du vivant. Les technologies protéomiques, et en particulier celles basées sur la spectrométrie de masse, permettent désormais de cartographier les protéomes à large échelle.

Source officielle

Proximité ontologique

Chimie

Chimie analytique: Spectrométrie de masse

Concepts associés (32)

Protéomique

La protéomique désigne la science qui étudie les protéomes, c'est-à-dire l'ensemble des protéines d'une cellule, d'un organite, d'un tissu, d'un organe ou d'un organisme à un moment donné et sous des conditions données. Dans la pratique, la protéomique s'attache à identifier de manière globale les protéines extraites d'une culture cellulaire, d'un tissu ou d'un fluide biologique, leur localisation dans les compartiments cellulaires, leurs éventuelles modifications post-traductionnelles ainsi que leur quantité.

Ion source

An ion source is a device that creates atomic and molecular ions. Ion sources are used to form ions for mass spectrometers, optical emission spectrometers, particle accelerators, ion implanters and ion engines. Electron ionization Electron ionization is widely used in mass spectrometry, particularly for organic molecules. The gas phase reaction producing electron ionization is M{} + e^- -> M^{+\bullet}{} + 2e^- where M is the atom or molecule being ionized, e^- is the electron, and M^{+\bullet} is the resulting ion.

Protein microarray

A protein microarray (or protein chip) is a high-throughput method used to track the interactions and activities of proteins, and to determine their function, and determining function on a large scale. Its main advantage lies in the fact that large numbers of proteins can be tracked in parallel. The chip consists of a support surface such as a glass slide, nitrocellulose membrane, bead, or microtitre plate, to which an array of capture proteins is bound. Probe molecules, typically labeled with a fluorescent dye, are added to the array.

Spectrométrie de masse

thumb|right|Spectromètre de masse La spectrométrie de masse est une technique physique d'analyse permettant de détecter et d'identifier des molécules d’intérêt par mesure de leur masse, et de caractériser leur structure chimique. Son principe réside dans la séparation en phase gazeuse de molécules chargées (ions) en fonction de leur rapport masse/charge (m/z). Elle est utilisée dans pratiquement tous les domaines scientifiques : physique, astrophysique, chimie en phase gazeuse, chimie organique, dosages, biologie, médecine, archéologie.

Séquençage des protéines

Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique. Elle est destinée à connaître le nombre, la nature chimique et l'ordre de tous les résidus d'acides aminés dans un polypeptide. Pour cela, si la protéine contient plus d'une chaîne polypeptidique, les chaînes doivent être d'abord séparées, puis purifiées. Généralement, toutes les liaisons disulfures seront réduites et les thiols ainsi obtenus alkylés.

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Séances de cours associées (64)

Explorer les protéines: structure, purification et analyse

Couvre les méthodes d'exploration, de purification et d'analyse des protéines, y compris le séquençage, la mesure de la concentration et la détection des anticorps.

Exploration de la structure protéique

Explore la composition, la synthèse, la purification et les techniques d'analyse des protéines pour comprendre la structure et la fonction des protéines.

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

Explore la spectrométrie de masse des protéines, les stratégies protéomiques, les techniques de séparation et les méthodes d'identification des protéines en utilisant les données MS / MS.

Spectrométrie de masse: Analyser des peptides avec Tandem MS

Couvre la spectrométrie de masse et les techniques tandem MS / MS pour l'analyse peptidique, en se concentrant sur l'ionisation, la fragmentation et l'identification de la séquence.

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

Couvre la spectrométrie de masse des protéines, les techniques de protéomique, les défis et les applications dans l'analyse de mélanges de protéines complexes.

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Spectrométrie de masse

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