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Séance de cours

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

Dans cours

CH-419: Protein mass spectrometry and proteomics

In systems biology, proteomics represents an essential pillar. The understanding of protein function and regulation provides key information to decipher the complexity of living systems. Proteomic technology now enables deep quantitative proteome mapping v ...

Description

Cette séance de cours couvre les principes fondamentaux de la spectrométrie de masse des protéines et de la protéomique, y compris une introduction à l'analyse des protéines, aux rappels de spectrométrie de masse, aux sources d'ionisation, aux analyseurs et aux détecteurs utilisés en protéomique. Il traite également des stratégies protéomiques, des flux de travail et des techniques de séparation, soulignant l'importance de la précision et de la résolution de masse dans l'identification des composés. L'instructeur se penche sur les concepts de défaut de masse, les isotopes, les charges et la nécessité d'un pouvoir de résolution élevé. Diverses méthodes d'ionisation telles que l'ionisation par électronébulisation (ESI) et la désorption/ionisation laser assistée par matrice (MALDI) sont expliquées, ainsi que la signification des analyseurs de masse en protéomique.

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Enseignant·e

Loïc Dayon

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Proximité ontologique

Chimie

Chimie analytique: Spectrométrie de masse

Concepts associés (32)

Spectrométrie de masse

thumb|right|Spectromètre de masse La spectrométrie de masse est une technique physique d'analyse permettant de détecter et d'identifier des molécules d’intérêt par mesure de leur masse, et de caractériser leur structure chimique. Son principe réside dans la séparation en phase gazeuse de molécules chargées (ions) en fonction de leur rapport masse/charge (m/z). Elle est utilisée dans pratiquement tous les domaines scientifiques : physique, astrophysique, chimie en phase gazeuse, chimie organique, dosages, biologie, médecine, archéologie.

Ionisation par électronébuliseur

thumb|Électronébuliseur L'ionisation par électronébuliseur ou ESI (de l'anglais en) est la dispersion d’un liquide sous forme de gouttelettes chargées électriquement. L'ionisation par électronébuliseur combine deux processus : formation des gouttelettes chargement des gouttelettes. La nébulisation des solutions par ESI est obtenue par une méthode électrostatique, i.e. en appliquant une différence de potentiel élevée (entre ±3 et ±5 kV) entre l’extrémité de l’émetteur (tube capillaire en acier inoxydable, jonction liquide) et un orifice situé à proximité.

Tandem mass spectrometry

Tandem mass spectrometry, also known as MS/MS or MS2, is a technique in instrumental analysis where two or more mass analyzers are coupled together using an additional reaction step to increase their abilities to analyse chemical samples. A common use of tandem MS is the analysis of biomolecules, such as proteins and peptides. The molecules of a given sample are ionized and the first spectrometer (designated MS1) separates these ions by their mass-to-charge ratio (often given as m/z or m/Q).

Ion source

An ion source is a device that creates atomic and molecular ions. Ion sources are used to form ions for mass spectrometers, optical emission spectrometers, particle accelerators, ion implanters and ion engines. Electron ionization Electron ionization is widely used in mass spectrometry, particularly for organic molecules. The gas phase reaction producing electron ionization is M{} + e^- -> M^{+\bullet}{} + 2e^- where M is the atom or molecule being ionized, e^- is the electron, and M^{+\bullet} is the resulting ion.

Quadrupole mass analyzer

In mass spectrometry, the quadrupole mass analyzer (or quadrupole mass filter) is a type of mass analyzer originally conceived by Nobel laureate Wolfgang Paul and his student Helmut Steinwedel. As the name implies, it consists of four cylindrical rods, set parallel to each other. In a quadrupole mass spectrometer (QMS) the quadrupole is the mass analyzer - the component of the instrument responsible for selecting sample ions based on their mass-to-charge ratio (m/z).

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Séances de cours associées (37)

Spectrométrie de masse : Détecteurs et techniques

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Couvre la spectrométrie de masse et les techniques tandem MS / MS pour l'analyse peptidique, en se concentrant sur l'ionisation, la fragmentation et l'identification de la séquence.

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Spectrométrie de masse: Techniques et applications

Explore les techniques de spectrométrie de masse pour l'analyse moléculaire et l'identification des protéines par des profils isotopiques et des modèles de fragmentation.

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