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Séance de cours

Séparation de l'ADN: méthodes et techniques

Dans cours

MICRO-560: BioMEMS

This course covers the main applications of micro devices for life science and biomedical applications. The course is organized by application topic. It is also covering the basic physical, biological, chemical, technological concepts, which are presented ...

Description

Cette séance de cours couvre diverses méthodes de séparation de l'ADN, y compris l'électrophorèse sur gel et l'électrophorèse capillaire. Il explique les principes derrière la migration de l'ADN dans les gels, l'utilisation de puces CE pour la séparation rapide, et les défis de la séparation de longs fragments d'ADN. La séance de cours traite également du dimensionnement de l'ADN dans les nanocanaux et du concept de prismes d'ADN pour séparer de longs fragments. En outre, il explore l'observation directe des sites de liaison des protéines sur l'ADN à l'aide de nanocanaux. La physique de l'ADN, telle que sa structure, sa charge et sa mobilité, est également expliquée dans le contexte des techniques de séparation.

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Enseignant·e

Philippe Renaud

Philippe Renaud is Professor at the Microsystem Laboratory (LMIS4) at EPFL. He is also the scientific director of the EPFL Center of MicroNanoTechnology (CMI). His main research area is related to micronano technologies in biomedical applications (BioMEMS) with emphasis on cell-chips, nanofluidics and bioelectronics. Ph. Renaud is invloved in many scientifics papers in his research area. He received his diploma in physics from the University of Neuchâtel (1983) and his Ph.D. degree from the University of Lausanne (1988). He was postdoctoral fellow at University of California, Berkeley (1988-89) and then at the IBM Zürich Research Laboratory in Switzerland (1990-91). In 1992, he joined the Sensors and Actuators group of the Swiss Center for Electronics and Microtechnology (CSEM) at Neuchâtel, Switzerland. He was appointed assistant professor at EPFL in 1994 and full professor in 1997. In summer 1996, he was visiting professor at the Tohoku University, Japan. Ph. Renaud is active in several scientific committee (scientific journals, international conferences, scientific advisory boards of companies, PhD thesis committee). He is also co-founder of the Nanotech-Montreux conference. Ph. Renaud is committed to valorization of basic research through his involvement in several high-tech start-up companies.

Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Biologie moléculaire: Biologie moléculaire

Concepts associés (30)

Électrophorèse sur gel

alt=Appareil à électrophorèse sur gel d'agarose|vignette|Appareil pour électrophorèse d'ADN en gel d'agarose. Le gel est horizontal baigne dans le tampon qui remplit la cuve. L'ADN est déposé dans des puits à une extrémité du gel. L'alimentation en arrière-plan fournit la tension électrique continue qui permet la migration des fragments d'ADN dans le gel. L'électrophorèse sur gel est une variante de l'électrophorèse de zones.

Empreinte génétique

Une empreinte génétique, ou profil génétique, est le résultat d'une analyse génétique de l'ADN, rendant possible l'identification d'une personne à partir d'une petite quantité de ses tissus biologiques (bulbe de cheveu, sang, salive, sécrétion vaginale, sperme). L'empreinte génétique repose sur le fait suivant : bien que deux humains aient une large majorité de leur patrimoine génétique identique, un certain ensemble de séquences dans leur ADN reste spécifique à chaque individu (en raison du polymorphisme).

Extraction d'ADN

L'extraction de l'ADN est une technique permettant d'isoler l'acide désoxyribonucléique (ADN) des cellules ou des tissus. L'ADN ainsi extrait peut ensuite être utilisé pour des recherches de biologie moléculaire, telles que le séquençage, la PCR ou le clonage. Il existe différents protocoles pour extraire l'ADN, qui suivent approximativement le même schéma de principe : Lyse des cellules Elimination des protéines Elimination des autres acides nucléiques (acide ribonucléique (ARN), etc.

Électrophorèse sur gel d'agarose

vignette|Cuve remplie de tampon et transformateur utilisés pour l'électrophorèse sur gel d'agarose. L'électrophorèse sur gel d'agarose est une méthode utilisée en biochimie et en biologie moléculaire pour séparer l'ADN, l'ARN ou des protéines en fonction de leur masse moléculaire. La technique de l'électrophorèse sur gel d'agarose est basée sur la séparation des acides nucléiques chargés négativement sous l'effet d'un champ électrique.

Séquençage de l'ADN

cadre|Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné. La séquence d’ADN contient l’information nécessaire aux êtres vivants pour survivre et se reproduire. Déterminer cette séquence est donc utile aussi bien pour les recherches visant à savoir comment vivent les organismes que pour des sujets appliqués.

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Séances de cours associées (32)

Électrophorèse : Acides aminés et analyse des protéines

Explore les acides aminés, l'analyse des protéines, la configuration du gradient de pH et les techniques d'électroblottage pour l'ADN et les protéines.

Caractérisation des protéines par électrophorèse

Explore la physique de l'électrophorèse pour la caractérisation des protéines, couvrant Native Gel, SDS-PAGE et 2D Gel.

Exploration des gènes et des génomes

Explore la structure des protéines, l'analyse de l'ADN, le séquençage des gènes et le projet du génome humain.

Exploration de la structure protéique

Explore la composition, la synthèse, la purification et les techniques d'analyse des protéines pour comprendre la structure et la fonction des protéines.

PCR et clonage de restriction

Couvre le génie génétique, les capteurs FRET, le clonage PCR et les constructions d'ADN pour des applications pratiques.

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Électrophorèse sur gel

Empreinte génétique

Extraction d'ADN

Électrophorèse sur gel d'agarose

Séquençage de l'ADN

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