Séance de cours

Exploration des gènes et des génomes

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Dans cours

CH-210: Biochimie

Les constituants biochimiques de l'organisme, protéines, glucides, lipides, à la lumière de l'évolution des concepts et des progrès en biologie moléculaire et génétique, sont étudiés. ...

Description

Cette séance de cours couvre l'exploration des gènes et des génomes, y compris la composition et la structure des protéines, la synthèse des protéines, la réaction en chaîne de la polymérase, le séquençage de l'ADN, les enzymes de restriction, l'électrophorèse de l'ADN sur gel et la technologie de l'ADN recombinant.

Enseignant·e

Christian Heinis

Enseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Thomas Julien Denis Emel, Alessandro Scapozza, Nathan Moïse De Sadeleer, Florian Handel, Hugo André Clerc, Frédéric Brantschen, Grégoire Menoud, Ines Michrafy, Jonathan Schmitt, Laura Elena Massaad A dirigé les thèses EPFL de Jeremy Touati, Shiyu Chen, Sophie Venet-Bonnot, Lisa Pollaro, Inmaculada Rentero Rebollo, Philippe Diderich, Charlotte Urech-Varenne, Silvia Bellotto, Davide Bertoldo, Alessandro Zorzi, Camille Villequey, Jonas Alfred Karl Wilbs, Grigory Ka

Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Biologie moléculaire: Biologie moléculaire

Génétique: Génomique

Concepts associés (31)

Massive parallel sequencing

Massive parallel sequencing or massively parallel sequencing is any of several high-throughput approaches to DNA sequencing using the concept of massively parallel processing; it is also called next-generation sequencing (NGS) or second-generation sequencing. Some of these technologies emerged between 1993 and 1998 and have been commercially available since 2005. These technologies use miniaturized and parallelized platforms for sequencing of 1 million to 43 billion short reads (50 to 400 bases each) per instrument run.

Site de restriction

Un site de restriction est une séquence particulière de nucléotides qui est reconnue par une enzyme de restriction comme un site de coupure dans la molécule d'ADN. Les sites sont généralement palindromiques, et une enzyme de restriction spécifique pourra couper entre deux nucléotides dans le site en question (enzyme de type II) ou en un autre endroit de la molécule (type I et type III). Par exemple, l'enzyme de restriction reconnaît la séquence bamh1et coupe entre le G et le A sur le brin du dessus et celui du dessous, laissant ainsi à la fin une extrémité AATT.

Séquençage shotgun

En génétique, le séquençage shotgun (littéralement séquençage "fusil de chasse") est une méthode utilisée pour séquencer des brins d'ADN aléatoires. On l'appelle ainsi par analogie avec le modèle de tir quasi-aléatoire en pleine expansion d'un fusil de chasse : cette métaphore illustre le caractère aléatoire de la fragmentation initiale de l'ADN génomique où l'on "arrose" tout le génome, un peu comme se dispersent les plombs de ce type d'arme à feu.

Whole genome sequencing

Whole genome sequencing (WGS), also known as full genome sequencing, complete genome sequencing, or entire genome sequencing, is the process of determining the entirety, or nearly the entirety, of the DNA sequence of an organism's genome at a single time. This entails sequencing all of an organism's chromosomal DNA as well as DNA contained in the mitochondria and, for plants, in the chloroplast. Whole genome sequencing has largely been used as a research tool, but was being introduced to clinics in 2014.

Électrophorèse sur gel de polyacrylamide

L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide ou PAGE est une technique utilisant un gel réticulé fabriqué au moment de l'emploi en mélangeant de l'acrylamide qui polymérise sous l'action de l'APS (persulfate d'ammonium ; réactif qui initie la réaction) et du TEMED ; catalyseur de la polymérisation] en donnant des chaînes linéaires. Le gel ainsi formé possède un réseau, dont les mailles sont de taille variable en fonction des proportions d'acrylamide et de bis-acrylamide utilisée, le gel obtenu se comporte donc comme un tamis moléculaire.

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Séances de cours associées (64)

L’auto-attraction de l’ADN : interactions médiées

Discute de l'auto-attraction de l'ADN et de ses interactions médiées.

Exploration des gènes et des génomes

Explore la structure des protéines, l'analyse de l'ADN, le séquençage des gènes et le projet du génome humain.

Mécanismes génétiques : Syndrome de Prader Willi

Explore les mécanismes génétiques du syndrome de Prader Willi et les techniques d'analyse de l'ADN.

ADN: PCR et techniques de séquençage

Explore l'ingénierie de l'ADN à travers la PCR, le séquençage Sanger, le projet du génome humain, l'ADN recombinant, la manipulation de l'ADN bactérien et CRISPR / Cas9.

Séquençage du génome et autisme Neurobiologie MOOC: Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Couvre le processus de préparation des bibliothèques et de traitement des données dans le séquençage du génome, et discute d'une étude à grande échelle sur la neurobiologie de l'autisme.

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Site de restriction

Séquençage shotgun

Whole genome sequencing

Électrophorèse sur gel de polyacrylamide

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