Séance de cours

Analyse génomique des données : outils de contrôle de la qualité

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Dans cours

MATH-474: Statistics for genomic data analysis

After a short introduction to basic molecular biology and genomic technologies, this course covers the most useful statistical concepts and methods for the analysis of genomic data. ...

Description

Cette séance de cours couvre les outils de contrôle de la qualité utilisés dans l'analyse des données génomiques, en mettant l'accent sur l'AQ/QC Affymetrix, la préparation d'échantillons QC, les données QC, les pic-ins, les commandes et les algorithmes MAS 5. Il explique l'importance des paramètres de qualité, du RMA-QC et du modèle additif RMA pour l'expression des gènes. L'instructeur discute des défis avec les mesures de qualité et la robustesse de l'analyse, en soulignant la nécessité de procédures robustes en présence d'objets aberrants et d'images.

Enseignant·e

Darlene Goldstein

Source officielle

Concepts associés (16)

Robust regression

In robust statistics, robust regression seeks to overcome some limitations of traditional regression analysis. A regression analysis models the relationship between one or more independent variables and a dependent variable. Standard types of regression, such as ordinary least squares, have favourable properties if their underlying assumptions are true, but can give misleading results otherwise (i.e. are not robust to assumption violations).

Contrôle qualité

vignette|Contrôle qualité du nylon, 1954, Malmö. Photographie conservée au musée nordique. Le contrôle qualité est un aspect de la gestion de la qualité. Le contrôle est une opération destinée à déterminer, avec des moyens appropriés, si le produit (y compris, services, documents, code source) contrôlé est conforme ou non à ses spécifications ou exigences préétablies et incluant une décision d'acceptation, de rejet ou de retouche. L'ancienne norme ISO 8402 (maintenant annulée) en donnait la définition suivante : (ISO8402:1994, § 2.

Régression linéaire

En statistiques, en économétrie et en apprentissage automatique, un modèle de régression linéaire est un modèle de régression qui cherche à établir une relation linéaire entre une variable, dite expliquée, et une ou plusieurs variables, dites explicatives. On parle aussi de modèle linéaire ou de modèle de régression linéaire. Parmi les modèles de régression linéaire, le plus simple est l'ajustement affine. Celui-ci consiste à rechercher la droite permettant d'expliquer le comportement d'une variable statistique y comme étant une fonction affine d'une autre variable statistique x.

Assurance qualité

On désigne par assurance qualité un moyen d'obtenir confiance dans l'assurance de la qualité c'est-à-dire dans l'aptitude de la société ou de l'organisation à satisfaire le niveau de qualité désiré. Le terme « assurance qualité » qui élide les articles naturellement présents dans la langue française est très commun du fait que le concept a été importé (anglicisme) de la langue anglaise où l'on parle de Quality assurance. Le terme assurance a donc ici la valeur de confiance que lui donne la langue anglaise.

Management de la qualité

vignette|La roue de Deming illustre le processus d'amélioration continue, l'un des principes fondamentaux du management de la qualité. Le management de la qualité, ou gestion de la qualité, est une discipline du management regroupant l'ensemble des concepts et méthodes visant à satisfaire les clients d'un organisme (en général les entreprises, associations, organismes publics) et à fournir des produits et services correspondant à leurs attentes.

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Gestion de la chaîne d'approvisionnement : outils et techniques

Explore les outils et les techniques de gestion de la chaîne d'approvisionnement, y compris l'amélioration continue, l'analyse des risques et la gestion Lean.

Régression robuste dans l'analyse des données génomiques

Explore une régression robuste dans l'analyse des données génomiques, en mettant l'accent sur la pondération des résidus importants pour une meilleure précision des estimations et des mesures d'évaluation de la qualité telles que NUSE et RLE.

Analyse de régression: Sélection du modèle et outils de diagnostic

Explore les outils d'analyse de régression, la sélection des modèles, les points influents, les valeurs aberrantes et les graphiques de diagnostic.

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