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Exploration des gènes et des génomes

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Dans cours

CH-210: Biochimie

Les constituants biochimiques de l'organisme, protéines, glucides, lipides, à la lumière de l'évolution des concepts et des progrès en biologie moléculaire et génétique, sont étudiés. ...

Description

Cette séance de cours couvre la composition et la structure des protéines, la synthèse des protéines, les protéomes, l'électrophorèse de l'ADN sur gel, la technologie de l'ADN recombinant, la réaction en chaîne de la polymérase, le séquençage de l'ADN et l'exploration des gènes et des génomes. Il explique l'application des enzymes de restriction, le mécanisme de protection contre les virus, et le séquençage de l'ADN en utilisant la méthode de Sanger. La séance de cours se penche également sur l'amplification des séquences d'ADN par la réaction en chaîne de la polymérase, le clivage des plasmides et le séquençage des génomes. Il se termine par une discussion sur l'histoire du séquençage de l'ADN et le projet du génome humain.

Enseignant·e

Christian Heinis

Enseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Thomas Julien Denis Emel, Alessandro Scapozza, Nathan Moïse De Sadeleer, Florian Handel, Hugo André Clerc, Frédéric Brantschen, Grégoire Menoud, Ines Michrafy, Jonathan Schmitt, Laura Elena Massaad A dirigé les thèses EPFL de Jeremy Touati, Shiyu Chen, Sophie Venet-Bonnot, Lisa Pollaro, Inmaculada Rentero Rebollo, Philippe Diderich, Charlotte Urech-Varenne, Silvia Bellotto, Davide Bertoldo, Alessandro Zorzi, Camille Villequey, Jonas Alfred Karl Wilbs, Grigory Ka

Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Génétique: Génomique

Biologie moléculaire: Biologie moléculaire

Concepts associés (32)

Whole genome sequencing

Whole genome sequencing (WGS), also known as full genome sequencing, complete genome sequencing, or entire genome sequencing, is the process of determining the entirety, or nearly the entirety, of the DNA sequence of an organism's genome at a single time. This entails sequencing all of an organism's chromosomal DNA as well as DNA contained in the mitochondria and, for plants, in the chloroplast. Whole genome sequencing has largely been used as a research tool, but was being introduced to clinics in 2014.

Projet Génome humain

vignette|Le génome humain est constitué de l'ensemble de l'information portée par nos 23 paires de chromosomes. Le (PGH, ou HGP pour l'anglais Human Genome Project) est un programme lancé fin 1988 dont la mission était d'établir le séquençage complet de l'ADN du génome humain. Son achèvement a été annoncé le . Le nouveau projet lancé dans la foulée en , ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements), donne des résultats importants sur l'ADN non codant humain.

Séquençage shotgun

En génétique, le séquençage shotgun (littéralement séquençage "fusil de chasse") est une méthode utilisée pour séquencer des brins d'ADN aléatoires. On l'appelle ainsi par analogie avec le modèle de tir quasi-aléatoire en pleine expansion d'un fusil de chasse : cette métaphore illustre le caractère aléatoire de la fragmentation initiale de l'ADN génomique où l'on "arrose" tout le génome, un peu comme se dispersent les plombs de ce type d'arme à feu.

Sanger sequencing

Sanger sequencing is a method of DNA sequencing that involves electrophoresis and is based on the random incorporation of chain-terminating dideoxynucleotides by DNA polymerase during in vitro DNA replication. After first being developed by Frederick Sanger and colleagues in 1977, it became the most widely used sequencing method for approximately 40 years. It was first commercialized by Applied Biosystems in 1986. More recently, higher volume Sanger sequencing has been replaced by next generation sequencing methods, especially for large-scale, automated genome analyses.

Projet de séquençage de génome

Les projets de séquençage de génome sont des projets scientifiques qui ont pour but d'obtenir les séquences complètes des génomes de différents organismes: bactéries, plantes, champignons, animaux, et humain. Ce travail nécessite la séquence de l'ADN de chacun des chromosomes de l'espèce. Pour une bactérie, il n'y a qu'un chromosome à séquencer. Pour l'espèce humaine, qui possède 22 paires de chromosomes et 2 chromosomes sexuels (X et Y), il y a 24 chromosomes à séquencer. Le projet génome humain est abouti depuis 2003.

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Séances de cours associées (64)

Exploration des gènes et des génomes

Explore les gènes, les génomes, les protéines et les techniques de séquençage de l'ADN.

Réplication de l'ADN et applications

Explore la réplication de l'ADN, la PCR, les techniques de séquençage, les applications de l'ADN synthétique, les systèmes d'administration de médicaments, l'origami de l'ADN et l'ingénierie tissulaire.

ADN: PCR et techniques de séquençage

Explore l'ingénierie de l'ADN à travers la PCR, le séquençage Sanger, le projet du génome humain, l'ADN recombinant, la manipulation de l'ADN bactérien et CRISPR / Cas9.

Exploration de la structure protéique

Explore la composition, la synthèse, la purification et les techniques d'analyse des protéines pour comprendre la structure et la fonction des protéines.

La génomique : un aperçu historique

Couvre le développement historique de la génomique, du séquençage Sanger aux technologies à haut débit et aux réductions de coûts, en soulignant l'impact d'acteurs clés tels que Craig Venter.

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Projet Génome humain

Séquençage shotgun

Sanger sequencing

Projet de séquençage de génome

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