Séance de cours

Permutation circulaire dans l'ingénierie des protéines

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Dans cours

CH-319: Experimental biochemistry and biophysics

A 7-week long (4+8 h) experiment where you plan and construct a fluorescent sensor protein starting from DNA bricks. The protein will be expressed in and purified from E.coli, characterized by biochemical and spectroscopic methods. Your report will be in ...

Description

Cette séance de cours explore la permutation circulaire dans l'ingénierie des protéines, une technique utilisée pour optimiser les protéines en introduisant de nouvelles terminaisons N et C sans modifier la structure des protéines. L'instructeur discute du concept de permutation circulaire, du processus de création de nouveaux termes et de l'importance des linkers dans le maintien de la fonctionnalité des protéines. En outre, la séance de cours couvre l'examen des paramètres FRET et l'application de la permutation circulaire dans l'optimisation FRET. Des exemples de permutation circulaire dans des indicateurs fluorescents génétiquement codés et des biocapteurs de tension sont également présentés.

Enseignant·e

Rudolf Hovius

Expertise Protein structure, expression & purificationÂ•Molecular interaction & receptor activationÂ•Fluorescence imaging & spectroscopySignalling & sensing Mission => Teaching: Lecture courses, tutorials and practicals in biochemistry, biophysical chemistry of membranes and signalling processes. Participating to the Commission d'Enseignement and Commission de l'Ecole Doctorale of Chemistry and Chemical Engineering.=> Research interests: Protein function and structure, Membrane protein (especially receptors

Source officielle

Concepts associés (16)

Protein engineering

Protein engineering is the process of developing useful or valuable proteins through the design and production of unnatural polypeptides, often by altering amino acid sequences found in nature. It is a young discipline, with much research taking place into the understanding of protein folding and recognition for protein design principles. It has been used to improve the function of many enzymes for industrial catalysis. It is also a product and services market, with an estimated value of $168 billion by 2017.

Protéine fluorescente verte

vignette|Aequorea victoria. La protéine fluorescente verte (souvent abrégé GFP, de l'anglais « Green Fluorescent Protein ») est une protéine ayant la propriété d'émettre une fluorescence de couleur verte. Issue d'une méduse (Aequorea victoria), cette protéine est intrinsèquement fluorescente sous l'action d'une enzyme, l'aequoréine, une luciférase qui agit en présence de calcium. Son gène peut être fusionné in-vitro au gène d'une protéine que l'on souhaite étudier.

Transfert d'énergie entre molécules fluorescentes

Le transfert d'énergie entre molécules fluorescentes ou transfert d'énergie par résonance de type Förster (en anglais, Förster resonance energy transfer ou FRET, resonance energy transfer ou RET ou electronic energy transfer ou EET), bien qu’observé par Perrin au début du , est décrit pour la première fois par Theodor Förster en 1946. Les applications de cette approche à l’étude des interactions protéiques apparaîtront vers la fin du . vignette|Figure 1. Conditions du FRET. A.

Protein design

Protein design is the rational design of new protein molecules to design novel activity, behavior, or purpose, and to advance basic understanding of protein function. Proteins can be designed from scratch (de novo design) or by making calculated variants of a known protein structure and its sequence (termed protein redesign). Rational protein design approaches make protein-sequence predictions that will fold to specific structures.

Génie génétique

Le génie génétique est l'ensemble des outils permettant de modifier la constitution génétique d'un organisme en supprimant, en introduisant ou en remplaçant de l'ADN. Celui-ci peut être introduit directement dans les cellules de l'organisme hôte ou dans des cellules cultivées ex vivo puis réintroduites dans l'organisme. Un prérequis au développement du génie génétique a été la mise au point de techniques recombinantes d'acide nucléique pour former de nouvelles combinaisons de matériel génétique héritable suivies de l'incorporation de ce matériel soit indirectement à travers un système vecteur ou directement par microinjection, macroinjection ou microencapsulation.

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Protéines: Ingénierie et Matériaux

Explore l'ingénierie des protéines, les matériaux à base d'élastine, la production de protéines de laboratoire, la prédiction de l'IA du pliage et les acides aminés non naturels.

Ingénierie des protéines et évolution in vitro

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Frontiers in Chem Bio: Protéines de capteurs bioluminescents

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