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Séance de cours

Réglementation génomique et médecine personnalisée

Dans cours

BIO-373: Genetics and genomics

The theoretical part of this course covers classical genetics and contemporary genomics. Because bioinformatics has become important for genomic research, the course also includes practical applications to genomic analyses using Python, including group pro ...

Description

Cette séance de cours couvre la détection des boucles de chromatine dans le locus de la bêta-globine, la distribution génomique des cis-eQTL, des trans eQTL et l'impact de la variation génomique sur l'expression des gènes. Il traite du potentiel des analyses génomiques en médecine personnalisée, de la chromotrypsis dans le contexte du cancer et de la génomique synthétique.

Enseignant·e·s (2)

Jacques Fellay

Jacques Fellay is a medical scientist with expertise in infectious diseases and human genomics. He obtained his MD from the University of Lausanne in 2002 and his PhD from University of Utrecht. After a clinical training in infectious diseases in Switzerland and a 4-years postdoctoral fellowship at Duke University, he joined the EPFL in April 2011 with an SNF Professorship. On top of his EPFL affiliation, Jacques is also Head of Precision Medicine at the University Hospital (CHUV) in Lausanne, Group Leader at the Swiss Institute of Bioinformatics, and Co-director of the Health2030 Genome Center at Campus Biotech in Geneva.

Bart Deplancke

Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Génétique: Génomique

Concepts associés (28)

Génomique

La génomique est une discipline de la biologie moderne. Elle étudie le fonctionnement d'un organisme, d'un organe, d'un cancer, etc. à l'échelle du génome, au lieu de se limiter à l'échelle d'un seul gène. La génomique se divise en deux branches : La génomique structurale, qui se charge du séquençage du génome entier ; La génomique fonctionnelle, qui vise à déterminer la fonction et l'expression des gènes séquencés en caractérisant le transcriptome et le protéome. La génomique est l'équivalent de la métabolomique pour les métabolites.

Expression génétique

L'expression des gènes, encore appelée expression génique ou expression génétique, désigne l'ensemble des processus biochimiques par lesquels l'information héréditaire stockée dans un gène est lue pour aboutir à la fabrication de molécules qui auront un rôle actif dans le fonctionnement cellulaire, comme les protéines ou les ARN. Même si toutes les cellules d'un organisme partagent le même génome, certains gènes ne sont exprimés que dans certaines cellules, à certaines périodes de la vie de l'organisme ou sous certaines conditions.

Locus de caractères quantitatifs

vignette|Locus de caractères quantitatifs Un locus de caractères quantitatifs (LCQ ou QTL pour quantitative trait loci) est une région plus ou moins grande d'ADN qui est étroitement associée à un caractère quantitatif, c'est-à-dire une région chromosomique où sont localisés un ou plusieurs gènes à impliqué dans caractère en question. L'hérédité de caractères quantitatifs se rapporte à une caractéristique phénotypique qui varie par degrés, et qui peut être attribuée à l'interaction entre deux ou plusieurs gènes et leur environnement (appelé aussi hérédité polygénique).

Functional genomics

Functional genomics is a field of molecular biology that attempts to describe gene (and protein) functions and interactions. Functional genomics make use of the vast data generated by genomic and transcriptomic projects (such as genome sequencing projects and RNA sequencing). Functional genomics focuses on the dynamic aspects such as gene transcription, translation, regulation of gene expression and protein–protein interactions, as opposed to the static aspects of the genomic information such as DNA sequence or structures.

Gene expression profiling

In the field of molecular biology, gene expression profiling is the measurement of the activity (the expression) of thousands of genes at once, to create a global picture of cellular function. These profiles can, for example, distinguish between cells that are actively dividing, or show how the cells react to a particular treatment. Many experiments of this sort measure an entire genome simultaneously, that is, every gene present in a particular cell. Several transcriptomics technologies can be used to generate the necessary data to analyse.

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Séances de cours associées (31)

Variation génomique et expression des gènes

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Neuroépigénétique: Régulation de la Chromatine et Formation de Mémoire

Introduisez le rôle de la régulation de la chromatine dans la formation de la mémoire, les influences génétiques et épigénétiques sur l'apprentissage et le potentiel des inhibiteurs de l'HDAC en tant qu'améliorateurs cognitifs.

Epigénomique : Méthylation de l'ADN et modifications de l'histone MOOC: Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Déplacez-vous dans la méthylation de l'ADN, les modifications de l'histone, la dysrégulation épigénétique dans les maladies, et les techniques pour étudier les interactions de la chromatine.

Régulation des gènes : Mécanismes de transcription et accessibilité de la chromatine MOOC: Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Explore la régulation des gènes grâce aux mécanismes de transcription et à l'accessibilité de la chromatine, en soulignant l'importance des facteurs de transcription et des réseaux de régulation des gènes.

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Concepts associés (28)

Génomique

Expression génétique

Locus de caractères quantitatifs

Functional genomics

Gene expression profiling

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