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Description

Cette séance de cours couvre le processus de mise en place des composants pour créer des modèles de cellules électriques biophysiquement détaillés, y compris la définition de la forme cellulaire, des canaux ioniques et des paramètres du modèle. Il explique également comment ajouter de la morphologie, des mécanismes et des paramètres pour créer un CellModel, ainsi que comment créer des protocoles pour optimiser les paramètres et exécuter des simulations. L'instructeur démontre comment exécuter des protocoles sur une cellule, analyser les traces de réponse et utiliser eFEL pour extraire des caractéristiques et des objectifs pour l'évaluation du modèle.

Dans MOOC

Simulation de la neuroscience

Source officielle

Concepts associés (32)

Simulation de phénomènes

La simulation de phénomènes est un outil utilisé dans le domaine de la recherche et du développement. Elle permet d'étudier les réactions d'un système à différentes contraintes pour en déduire les résultats recherchés en se passant d'expérimentation. Les systèmes technologiques (infrastructures, véhicules, réseaux de communication, de transport ou d'énergie) sont soumis à différentes contraintes et actions. Le moyen le plus simple d'étudier leurs réactions serait d'expérimenter, c'est-à-dire d'exercer l'action souhaitée sur l'élément en cause pour observer ou mesurer le résultat.

Simulation informatique

vignette|upright=1|Une simulation informatique, sur une étendue de , de l'évolution du typhon Mawar produite par le Modèle météorologique Weather Research and Forecasting La simulation informatique ou numérique est l'exécution d'un programme informatique sur un ordinateur ou réseau en vue de simuler un phénomène physique réel et complexe (par exemple : chute d’un corps sur un support mou, résistance d’une plateforme pétrolière à la houle, fatigue d’un matériau sous sollicitation vibratoire, usure d’un roulem

Simulation software

Simulation software is based on the process of modeling a real phenomenon with a set of mathematical formulas. It is, essentially, a program that allows the user to observe an operation through simulation without actually performing that operation. Simulation software is used widely to design equipment so that the final product will be as close to design specs as possible without expensive in process modification. Simulation software with real-time response is often used in gaming, but it also has important industrial applications.

Simulation à événements discrets

La simulation à évènements discrets est une technique utilisée dans le cadre de l’étude de la dynamique des systèmes. Elle consiste en une modélisation informatique où le changement de l'état d'un système, au cours du temps, est une suite d'évènements discrets. Chaque évènement arrive à un instant donné et modifie l'état du système. De nos jours, cette technique est couramment utilisée tant par les industries et les entreprises de services afin de concevoir, optimiser et valider leurs organisations que par les centres de recherche dans l’optique d’étudier les systèmes complexes non linéaires.

Canal ionique

Un canal ionique est une protéine membranaire qui permet le passage à grande vitesse d'un ou plusieurs ions. Il existe de nombreux types de canaux ioniques. Ils peuvent être sélectivement perméables à un ion tel que le sodium, le calcium, le potassium ou l'ion chlorure, ou bien à plusieurs ions à la fois. Les canaux ioniques sont présents dans la membrane de toutes les cellules. Ils ont un rôle central dans la physiologie des cellules excitables comme les neurones ou les cellules musculaires et cardiaques.

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Séances de cours associées (64)

Modélisation de l'activité électrique du neurone MOOC: Simulation de la neuroscience

Explore la modélisation de l'activité électrique du neurone, y compris les canaux ioniques et les concentrations, l'équation de Nernst et le potentiel de repos.

Simulation de réseau et dynamique d'activité

Explore la simulation du réseau neuronal, la dynamique d'activité et les processus de validation afin d'assurer des prévisions précises.

Simulation exacte des diffusions de Wright-Fisher couplées

Explore la simulation exacte des diffusions de Wright-Fisher couplées, couvrant la génétique des populations, les réseaux de loci en interaction et les défis de diffusion.

Optimisation du modèle avec eFel et BluePyOpt

Couvre le processus d'optimisation des paramètres du modèle neuronal en utilisant eFel et BluePyOpt.

Canaux ioniques: Structure et fonction

Explore la structure et la fonction des canaux ioniques, leur classification, leur perméabilité membranaire et leur rôle dans les activités monocellulaires.

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Simulation de phénomènes

Simulation informatique

Simulation software

Simulation à événements discrets

Canal ionique

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