Séance de cours

Simulation exacte des diffusions de Wright-Fisher couplées

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Description

Cette séance de cours de l'instructeur couvre la simulation exacte des diffusions de Wright-Fisher couplées, en mettant l'accent sur la motivation, le contexte et l'application des résultats de simulation. La séance de cours s'inscrit dans le contexte théorique de la génétique des populations, des réseaux de loci en interaction et des défis de la simulation des diffusions. Il explique l'algorithme de rejet exact pour les diffusions et son application dans des contextes multidimensionnels. La séance de cours traite également des complexités et des stratégies liées à l'échantillonnage à partir des distributions des candidats et de l'évaluation des événements décisionnels. La présentation se termine par un résumé des avantages et des applications potentielles des techniques de simulation exactes.

Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Génétique: Génétique des populations

Concepts associés (32)

Dérive génétique

La dérive génétique est l'évolution d'une population ou d'une espèce causée par des événements aléatoires, impossibles à prévoir. Du point de vue génétique, c'est la modification de la fréquence d'un allèle, ou d'un génotype, au sein d'une population, indépendamment des mutations, de la sélection naturelle et des migrations. La dérive génétique est causée par des événements aléatoires et imprévisibles, comme le hasard des rencontres des spermatozoïdes et des ovules, dans le cas d'une reproduction sexuée.

Simulation informatique

vignette|upright=1|Une simulation informatique, sur une étendue de , de l'évolution du typhon Mawar produite par le Modèle météorologique Weather Research and Forecasting La simulation informatique ou numérique est l'exécution d'un programme informatique sur un ordinateur ou réseau en vue de simuler un phénomène physique réel et complexe (par exemple : chute d’un corps sur un support mou, résistance d’une plateforme pétrolière à la houle, fatigue d’un matériau sous sollicitation vibratoire, usure d’un roulem

Stochastic simulation

A stochastic simulation is a simulation of a system that has variables that can change stochastically (randomly) with individual probabilities. Realizations of these random variables are generated and inserted into a model of the system. Outputs of the model are recorded, and then the process is repeated with a new set of random values. These steps are repeated until a sufficient amount of data is gathered. In the end, the distribution of the outputs shows the most probable estimates as well as a frame of expectations regarding what ranges of values the variables are more or less likely to fall in.

Genetic variation

Genetic variation is the difference in DNA among individuals or the differences between populations among the same species. The multiple sources of genetic variation include mutation and genetic recombination. Mutations are the ultimate sources of genetic variation, but other mechanisms, such as genetic drift, contribute to it, as well. Genetic variation can be identified at many levels. Identifying genetic variation is possible from observations of phenotypic variation in either quantitative traits (traits that vary continuously and are coded for by many genes (e.

Simulation de phénomènes

La simulation de phénomènes est un outil utilisé dans le domaine de la recherche et du développement. Elle permet d'étudier les réactions d'un système à différentes contraintes pour en déduire les résultats recherchés en se passant d'expérimentation. Les systèmes technologiques (infrastructures, véhicules, réseaux de communication, de transport ou d'énergie) sont soumis à différentes contraintes et actions. Le moyen le plus simple d'étudier leurs réactions serait d'expérimenter, c'est-à-dire d'exercer l'action souhaitée sur l'élément en cause pour observer ou mesurer le résultat.

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Génomique : variation génétique humaine

Explore la variation génétique humaine, les groupes sanguins, la détection du SNP et l'analyse du génome.

Variation génétique dans les populations

Explore la variation génétique des populations, la loi Hardy-Weinberg, la sélection naturelle, et plus encore.

Genes Mirror Géographie en Europe

Couvre l'analyse des composantes principales à l'aide de matrices pour rapprocher les données génétiques.

Génétique : histoire et concepts clés

Couvre l'histoire de la génétique, des concepts clés, de la structure de l'ADN, de l'expression des gènes et du génie génétique.

Méthodes numériques stochastiques efficaces

Explore des méthodes numériques stochastiques efficaces pour la modélisation et l'apprentissage, couvrant des sujets comme le moteur d'analyse et les inhibiteurs de la kinase.

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Dérive génétique

Simulation informatique

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Genetic variation

Simulation de phénomènes

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