Séance de cours

Protéomique et spectrométrie de masse

Graph Chat

Chattez avec Graph Search

Posez n’importe quelle question sur les cours, conférences, exercices, recherches, actualités, etc. de l’EPFL ou essayez les exemples de questions ci-dessous.

AVERTISSEMENT : Le chatbot Graph n'est pas programmé pour fournir des réponses explicites ou catégoriques à vos questions. Il transforme plutôt vos questions en demandes API qui sont distribuées aux différents services informatiques officiellement administrés par l'EPFL. Son but est uniquement de collecter et de recommander des références pertinentes à des contenus que vous pouvez explorer pour vous aider à répondre à vos questions.

Dans cours

CH-419: Protein mass spectrometry and proteomics

In systems biology, proteomics represents an essential pillar. The understanding of protein function and regulation provides key information to decipher the complexity of living systems. Proteomic technology now enables deep quantitative proteome mapping v ...

Description

Cette séance de cours couvre les principes et les techniques de la spectrométrie de masse des protéines et de la protéomique, en se concentrant sur l'électrophorèse sur gel, la focalisation isoélectrique et la chromatographie liquide. Il explique l'importance de la séparation, de l'échantillonnage et de la préparation des protéines, soulignant la nécessité d'une séparation en raison de la diversité des séquences et des concentrations de protéines. La séance de cours traite également de l'utilisation de la spectrométrie de masse en tandem pour l'identification des protéines et la génération de spectres de masse en tandem. Divers montages d'électrophorèse, polymérisation sur gel de polyacrylamide et techniques 1D SDS PAGE sont expliqués en détail, ainsi que les propriétés des acides aminés et leur rôle dans la focalisation isoélectrique. La séance de cours se termine par une discussion sur la charge des polypeptides et la génération de gradients de pH pour la séparation des protéines.

Enseignant·e

Loïc Dayon

Enseignement et PhD Cours Protein mass spectrometry and proteomics CH-419 L'analyse protéomique est un pilier essentiel de la biologie des systèmes, permettant une meilleure compréhension du vivant. Les technologies protéomiques, et en particulier celles basées sur la spectrométrie de masse, permettent désormais de cartographier les protéomes à large échelle.

Source officielle

Concepts associés (32)

Électrophorèse sur gel d'agarose

vignette|Cuve remplie de tampon et transformateur utilisés pour l'électrophorèse sur gel d'agarose. L'électrophorèse sur gel d'agarose est une méthode utilisée en biochimie et en biologie moléculaire pour séparer l'ADN, l'ARN ou des protéines en fonction de leur masse moléculaire. La technique de l'électrophorèse sur gel d'agarose est basée sur la séparation des acides nucléiques chargés négativement sous l'effet d'un champ électrique.

Spectrométrie de masse

thumb|right|Spectromètre de masse La spectrométrie de masse est une technique physique d'analyse permettant de détecter et d'identifier des molécules d’intérêt par mesure de leur masse, et de caractériser leur structure chimique. Son principe réside dans la séparation en phase gazeuse de molécules chargées (ions) en fonction de leur rapport masse/charge (m/z). Elle est utilisée dans pratiquement tous les domaines scientifiques : physique, astrophysique, chimie en phase gazeuse, chimie organique, dosages, biologie, médecine, archéologie.

Chromatographie en phase liquide-spectrométrie de masse

La chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse (en anglais Liquid chromatography-mass spectrometry ou LC-MS) est une méthode d'analyse qui combine les performances de la chromatographie en phase liquide et de la spectrométrie de masse afin d'identifier et/ou de quantifier précisément de nombreuses substances. Une unité LC-MS est composée de deux blocs principaux : un chromatographe en phase liquide et un spectromètre de masse. Catégorie:Méthode de la biochimie Catégorie:Chromatogra

Tandem mass spectrometry

Tandem mass spectrometry, also known as MS/MS or MS2, is a technique in instrumental analysis where two or more mass analyzers are coupled together using an additional reaction step to increase their abilities to analyse chemical samples. A common use of tandem MS is the analysis of biomolecules, such as proteins and peptides. The molecules of a given sample are ionized and the first spectrometer (designated MS1) separates these ions by their mass-to-charge ratio (often given as m/z or m/Q).

Ion-mobility spectrometry–mass spectrometry

Ion mobility spectrometry–mass spectrometry (IMS-MS) is an analytical chemistry method that separates gas phase ions based on their interaction with a collision gas and their masses. In the first step, the ions are separated according to their mobility through a buffer gas on a millisecond timescale using an ion mobility spectrometer. The separated ions are then introduced into a mass analyzer in a second step where their mass-to-charge ratios can be determined on a microsecond timescale.

Afficher plus

Séances de cours associées (64)

Spectrométrie de masse des protéines et protéomique

Explore la spectrométrie de masse des protéines, les techniques chromatographiques et les flux de travail protéomiques quantitatifs, y compris les méthodes de marquage SILAC et isobare.

Explorer les protéines: structure, purification et analyse

Couvre les méthodes d'exploration, de purification et d'analyse des protéines, y compris le séquençage, la mesure de la concentration et la détection des anticorps.

Protéomique et spectrométrie de masse

Couvre les bases de la protéomique, de la spectrométrie de masse, de la synthèse des protéines et des acides aminés, en soulignant l'importance du poids moléculaire et de l'abondance isotopique.

Protéomique: étapes et techniques de digestion des protéines

Fournit un aperçu des étapes clés de la protéomique, en mettant l'accent sur la digestion des protéines et les techniques utilisées pour l'analyse.

Fondamentaux de la spectrométrie de masse

Couvre les principes fondamentaux de la spectrométrie de masse, y compris les méthodes d'ionisation, les analyseurs de masse et le séquençage peptidique.

Afficher plus

Concepts associés (32)

Électrophorèse sur gel d'agarose

Spectrométrie de masse

Chromatographie en phase liquide-spectrométrie de masse

Tandem mass spectrometry

Ion-mobility spectrometry–mass spectrometry

Afficher plus