Séance de cours

ARN-séq à cellule unique et résolu spatialement

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Description

Cette séance de cours porte sur l'importance de l'ARN-séq monocellulaire pour la résolution de populations cellulaires spécifiques, le processus de dissociation tissulaire, la capture d'ADNc, la synthèse de l'ADNc, le tri des flux, les microfluidiques, le barcoding, le contrôle de la qualité et l'analyse de l'expression génétique différentielle. Il présente également des exemples de transcriptomiques unicellulaires dans le système nerveux de la souris.

Dans MOOC

Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Source officielle

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Proximité ontologique

Biologie

Génétique: Génomique

Anatomie: Neuroanatomie

Concepts associés (32)

Gene expression profiling

In the field of molecular biology, gene expression profiling is the measurement of the activity (the expression) of thousands of genes at once, to create a global picture of cellular function. These profiles can, for example, distinguish between cells that are actively dividing, or show how the cells react to a particular treatment. Many experiments of this sort measure an entire genome simultaneously, that is, every gene present in a particular cell. Several transcriptomics technologies can be used to generate the necessary data to analyse.

Transcriptomique

La transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARN messagers produits lors du processus de transcription d'un génome. Elle repose sur la quantification systématique de ces ARNm, ce qui permet d'avoir une indication relative du taux de transcription de différents gènes dans des conditions données. Plusieurs techniques permettent d'avoir accès à cette information, en particulier celle des puces à ADN, celle de la PCR quantitative ou encore celle du séquençage systématique d'ADN complémentaires. Métatransc

Analyse en série de l'expression des gènes

L'analyse en série de l'expression des gènes (en anglais, Serial Analysis of Gene Expression ou SAGE) est une technique de biologie moléculaire permettant l'analyse de la population en ARNm d'un échantillon donné (organisme, cellules, tissus, etc.). La méthode originelle a été mise au point, et publiée en 1995, par le du centre d'oncologie de l'université Johns-Hopkins. La méthode SAGE est basée sur l'isolation de séquences spécifiques (étiquettes) de chaque ARN, la production des ADN complémentaires (ADNc) correspondant, la production d'une molécule d'ADN synthétique comportant tous ces ADNc, puis le séquençage de cette molécule.

Transcriptome

vignette|Puces à ADN employée pour analyser l'expression de gènes humains à gauche, de souris à droite. Le transcriptome est l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome. L'analyse transcriptomique peut caractériser le transcriptome d'un tissu particulier, d'un type cellulaire, ou comparer les transcriptomes entre différentes conditions expérimentales.

Expression génétique

L'expression des gènes, encore appelée expression génique ou expression génétique, désigne l'ensemble des processus biochimiques par lesquels l'information héréditaire stockée dans un gène est lue pour aboutir à la fabrication de molécules qui auront un rôle actif dans le fonctionnement cellulaire, comme les protéines ou les ARN. Même si toutes les cellules d'un organisme partagent le même génome, certains gènes ne sont exprimés que dans certaines cellules, à certaines périodes de la vie de l'organisme ou sous certaines conditions.

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Séances de cours associées (64)

Cycle de vie des protéines

Couvre l'expression génique, le cycle de vie des protéines et le code génétique dans les neurosciences.

Analyse des transcriptomes en vrac : analyse du flux de travail et de l'expression génique de l'ARN-seq MOOC: Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Explique la transcriptomique, le flux de travail de l'ARN-seq et l'analyse de l'expression des gènes pour les biomarqueurs de maladies.

Atlas BrainSpan du développement du cerveau humain

Couvre l'Atlas BrainSpan, cartographiant l'expression génétique dans le cerveau humain en développement.

Données disponibles sur les atlas du cerveau humain d'Allen

Couvre les données disponibles sur les atlas du cerveau humain Allen, y compris l'analyse de l'expression génétique et l'Atlas BrainSpan.

Mice transgénique: Cre-Lines et Optogénétique

Couvre les souris transgéniques utilisant les lignes de Cre et l'optogénétique, explorant les techniques de manipulation des cellules neurales et l'expression génétique spécifique à la région du cerveau.

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Concepts associés (32)

Gene expression profiling

Transcriptomique

Analyse en série de l'expression des gènes

Transcriptome

Expression génétique

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