Séance de cours

Analyse des transcriptomes en vrac : analyse du flux de travail et de l'expression génique de l'ARN-seq

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Description

Cette séance de cours porte sur l'importance de la transcriptomique, y compris les niveaux d'expression des gènes, les variantes d'épissage et la régulation post-transcriptionnelle. Il explique le flux de travail de l'ARN-seq, de l'extraction à la cartographie sur le génome. L'analyse de l'expression différentielle des gènes est également discutée, en mettant l'accent sur l'identification des changements d'expression liés aux maladies et la recherche de biomarqueurs pour certains types de cellules.

Dans MOOC

Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

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Proximité ontologique

Biologie

Génétique: Génétique moléculaire, Génomique

Concepts associés (32)

Régulation de l'expression des gènes

La régulation de l'expression des gènes désigne l'ensemble de mécanismes mis en œuvre pour passer de l'information génétique incluse dans une séquence d'ADN à un produit de gène fonctionnel (ARN ou protéine). Elle a pour effet de moduler, d'augmenter ou de diminuer la quantité des produits de l'expression des gènes (ARN, protéines). Toutes les étapes allant de la séquence d'ADN au produit final peuvent être régulées, que ce soit la transcription, la maturation des ARNm, la traduction des ARNm ou la stabilité des ARNm et protéines.

Gene expression profiling

In the field of molecular biology, gene expression profiling is the measurement of the activity (the expression) of thousands of genes at once, to create a global picture of cellular function. These profiles can, for example, distinguish between cells that are actively dividing, or show how the cells react to a particular treatment. Many experiments of this sort measure an entire genome simultaneously, that is, every gene present in a particular cell. Several transcriptomics technologies can be used to generate the necessary data to analyse.

Transcriptomique

La transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARN messagers produits lors du processus de transcription d'un génome. Elle repose sur la quantification systématique de ces ARNm, ce qui permet d'avoir une indication relative du taux de transcription de différents gènes dans des conditions données. Plusieurs techniques permettent d'avoir accès à cette information, en particulier celle des puces à ADN, celle de la PCR quantitative ou encore celle du séquençage systématique d'ADN complémentaires. Métatransc

Expression génétique

L'expression des gènes, encore appelée expression génique ou expression génétique, désigne l'ensemble des processus biochimiques par lesquels l'information héréditaire stockée dans un gène est lue pour aboutir à la fabrication de molécules qui auront un rôle actif dans le fonctionnement cellulaire, comme les protéines ou les ARN. Même si toutes les cellules d'un organisme partagent le même génome, certains gènes ne sont exprimés que dans certaines cellules, à certaines périodes de la vie de l'organisme ou sous certaines conditions.

Régulation de la transcription

La régulation de la transcription est la phase du contrôle de l'expression des gènes agissant au niveau de la transcription de l'ADN. Cette régulation modifiera la quantité d'ARN produit. Cette régulation est principalement effectuée par la modulation du taux de transcription par l'intervention de facteurs de transcription qui se classent en deux catégories : les éléments cis-regulateurs géniques, en coopération avec les facteurs transprotéiques. Il existe également des mécanismes de régulation de la terminaison de la transcription.

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Séances de cours associées (64)

ARN-séq à cellule unique et résolu spatialement MOOC: Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Explore l'ARN-séq monocellulaire, la dissociation tissulaire, les méthodes de capture et l'analyse de l'expression génétique différentielle.

Structure de l'ADN et expression des gènes

Explore la structure de l'ADN, l'expression des gènes, la transcription de l'ARN et la fabrication de protéines dans les cellules, y compris le rôle crucial de l'ARN polymérase.

Cycle de vie des protéines

Couvre l'expression génique, le cycle de vie des protéines et le code génétique dans les neurosciences.

Régulation de la transcription et de la traduction

Explore la régulation des processus de transcription et de traduction, en se concentrant sur les mécanismes de contrôle et l'épissage alternatif chez les eucaryotes.

Structure et transcription de l'ADN

Explore la structure de l'ADN, la réplication, la transcription, la traduction des ARNm et la régulation de l'expression des gènes.

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Régulation de l'expression des gènes

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Transcriptomique

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