Séance de cours

Données disponibles sur les atlas du cerveau humain d'Allen

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Description

Cette séance de cours porte sur les données disponibles à partir des atlas du cerveau humain Allen, y compris le pipeline de production et d'analyse de données de transcriptome, l'acquisition de spécimens, les modalités des données d'imagerie, l'informatique et l'analyse de données, l'analyse de l'expression génétique et l'Atlas BrainSpan du cerveau humain en développement.

Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Génétique: Génomique

Concepts associés (32)

Cerveau humain

Le 'cerveau humain' a la même structure générale que le cerveau des autres mammifères, mais il est celui dont la taille relative par rapport au reste du corps est devenue la plus grande au cours de l'évolution. Si la baleine bleue a le cerveau le plus lourd avec contre environ pour celui de l'homme, le coefficient d'encéphalisation humain est le plus élevé et est sept fois supérieur à celui de la moyenne des mammifères.

Cerveau

vignette|Cerveau d'un chimpanzé. Le cerveau est le principal organe du système nerveux des animaux bilatériens. Ce terme tient du langage courant (non scientifique) et chez les chordés, comme les humains, il peut désigner l'encéphale, ou uniquement une partie de l'encéphale, le prosencéphale (télencéphale + diencéphale), voire seulement le télencéphale. Néanmoins, dans cet article, le terme « cerveau » prend son sens le plus large. Le cerveau des chordés est situé dans la tête, protégé par le crâne chez les craniés, et son volume varie grandement d'une espèce à l'autre.

Transcriptome

vignette|Puces à ADN employée pour analyser l'expression de gènes humains à gauche, de souris à droite. Le transcriptome est l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome. L'analyse transcriptomique peut caractériser le transcriptome d'un tissu particulier, d'un type cellulaire, ou comparer les transcriptomes entre différentes conditions expérimentales.

Gene expression profiling

In the field of molecular biology, gene expression profiling is the measurement of the activity (the expression) of thousands of genes at once, to create a global picture of cellular function. These profiles can, for example, distinguish between cells that are actively dividing, or show how the cells react to a particular treatment. Many experiments of this sort measure an entire genome simultaneously, that is, every gene present in a particular cell. Several transcriptomics technologies can be used to generate the necessary data to analyse.

Transcriptomique

La transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARN messagers produits lors du processus de transcription d'un génome. Elle repose sur la quantification systématique de ces ARNm, ce qui permet d'avoir une indication relative du taux de transcription de différents gènes dans des conditions données. Plusieurs techniques permettent d'avoir accès à cette information, en particulier celle des puces à ADN, celle de la PCR quantitative ou encore celle du séquençage systématique d'ADN complémentaires. Métatransc

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Atlas BrainSpan du développement du cerveau humain

Couvre l'Atlas BrainSpan, cartographiant l'expression génétique dans le cerveau humain en développement.

Les Microcircuits de Striatum dans le Silico

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Effectuer une recherche dans l'Atlas Allen du cerveau

Couvre le tutoriel sur l'exécution d'une recherche dans l'Atlas Allen du cerveau, explorant les données d'expression génétique.

Analyse des transcriptomes en vrac : analyse du flux de travail et de l'expression génique de l'ARN-seq MOOC: Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Explique la transcriptomique, le flux de travail de l'ARN-seq et l'analyse de l'expression des gènes pour les biomarqueurs de maladies.

Mice transgénique: Cre-Lines et Optogénétique

Couvre les souris transgéniques utilisant les lignes de Cre et l'optogénétique, explorant les techniques de manipulation des cellules neurales et l'expression génétique spécifique à la région du cerveau.

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Concepts associés (32)

Cerveau humain

Cerveau

Transcriptome

Gene expression profiling

Transcriptomique

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