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Le Laboratoire de Biologie Computationnelle et Systèmes de l'UPNAE, dirigé par le Prof. Naef à l'EPFL, se concentre sur l'étude quantitative des systèmes biologiques, notamment l'interaction entre la physique et la biologie. Les domaines de recherche comprennent les réseaux de régulation des gènes circadiens, la chronobiologie du foie, l'éclatement transcriptionnel, le patronage du développement et la régulation des gènes. Le laboratoire utilise une combinaison de méthodes théoriques, de calcul et expérimentales pour étudier ces systèmes, l'accent étant mis récemment sur la compréhension de la régulation circadienne des gènes du foie dans le temps et dans l'espace. Le laboratoire a reçu des subventions prestigieuses et recherche activement de nouveaux membres d'équipe pour des projets de recherche en régulation quantitative des gènes et en chronobiologie.