Publication

Digital Holographic Imaging for Label-Free Phenotypic Profiling, Cytotoxicity, and Chloride Channels Target Screening

Gerardo Turcatti
2015
Book Chapters

Résumé

Cellular assays using label-free Digital Holographic Microscopy (DHM) have been previously validated for cell viability assays in a drug screening context. Our automated DHM system allows performing fast and cost-effective screening assays for a wide range of applications for monitoring cell morphological changes and cell movements upon interaction with interfering compounds. In addition to these classic phenotypic assays, it has been demonstrated that target-based cellular assays can also be addressed by DHM for therapeutically relevant chloride channel receptors. Our DH-imaging (DHI) technology, potentially scalable for screening by imaging approaches in a high-throughput manner can also deliver highly informative data through long term experiments. Three examples of phenotypic screens are detailed in the present chapter: a label-free profiling approach, a cell proliferation assay, and methods for monitoring the activity of the GABAA chloride channel receptor.

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https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/dc4e6bac-f56e-44a0-9d27-a42f2fb890c7

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Criblage à haut débit

thumb|Machine de criblage à haut débit en Allemagne Le criblage à haut débit (high-throughput screening, HTS) désigne dans le domaine de la pharmacologie, de la biochimie, de la génomique et de la protéomique, les techniques visant à étudier et à identifier dans les chimiothèques et ciblothèques, des molécules aux propriétés nouvelles, biologiquement actives. L’expression haut débit évoque ici l’utilisation de la robotique, de l’informatique et de la bio-informatique pour accélérer la phase de test des molécules, protéines, catalyseurs, etc.

High-content screening

High-content screening (HCS), also known as high-content analysis (HCA) or cellomics, is a method that is used in biological research and drug discovery to identify substances such as small molecules, peptides, or RNAi that alter the phenotype of a cell in a desired manner. Hence high content screening is a type of phenotypic screen conducted in cells involving the analysis of whole cells or components of cells with simultaneous readout of several parameters.

Chimioprotéomique

La chimioprotéomique (chimio, racine française) ou chemoprotéomique (chemo, racine latine ; provenant du mot anglais chemoproteomics) ou protéomique chimique peut être définie comme la science ayant pour objet l'étude de la réponse d'un protéome à un composé chimique. Elle est une sous-discipline de la biologie chimique, qui utilise les techniques de protéomique et en particulier le séquençage des protéines par spectrométrie de masse pour étudier les interactions d'une molécule avec les protéines contenues dans un échantillon biologique.

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Mechanism-driven screening of membrane-targeting and pore-forming antimicrobial peptides