Publication

DNA extraction from soil samples: Time for high throughput efficacy

Luiz Felippe De Alencastro
2011
Posters

Résumé

Total DNA extraction is the key stage allowing the implementation of various downstream applications in molecular ecology. The widespread application of downstream technologies has led to an increasing demand for highly pure biomolecules. Manual methods and proprietary extraction kits used for the purification of nucleic acids can be laborious and time‐consuming. The breadth of sample types encountered and the increasing number of samples processed result in seeking new ways to enhance sample preparation efficiency and reliability. Representativeness, sensitivity and reproducibility are essential requirements for such an extraction technique that should be applied in a high throughput mode.

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/ac3ad9af-a473-4927-8ce6-3bbba0bfa53f

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Concepts associés (32)

Criblage à haut débit

thumb|Machine de criblage à haut débit en Allemagne Le criblage à haut débit (high-throughput screening, HTS) désigne dans le domaine de la pharmacologie, de la biochimie, de la génomique et de la protéomique, les techniques visant à étudier et à identifier dans les chimiothèques et ciblothèques, des molécules aux propriétés nouvelles, biologiquement actives. L’expression haut débit évoque ici l’utilisation de la robotique, de l’informatique et de la bio-informatique pour accélérer la phase de test des molécules, protéines, catalyseurs, etc.

Extraction d'ADN

L'extraction de l'ADN est une technique permettant d'isoler l'acide désoxyribonucléique (ADN) des cellules ou des tissus. L'ADN ainsi extrait peut ensuite être utilisé pour des recherches de biologie moléculaire, telles que le séquençage, la PCR ou le clonage. Il existe différents protocoles pour extraire l'ADN, qui suivent approximativement le même schéma de principe : Lyse des cellules Elimination des protéines Elimination des autres acides nucléiques (acide ribonucléique (ARN), etc.

Séquençage de l'ADN

cadre|Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné. La séquence d’ADN contient l’information nécessaire aux êtres vivants pour survivre et se reproduire. Déterminer cette séquence est donc utile aussi bien pour les recherches visant à savoir comment vivent les organismes que pour des sujets appliqués.

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