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Protocol to quantify glioblastoma cell invasion and nuclear deformations in 3D hydrogels

2026

Résumé

Here, we present a protocol to quantify 3D invasion and nuclear deformation from time-lapse imaging of U251 glioblastoma spheroids embedded in Matrigel. We describe steps for computing a time-resolved radial invasion index through epifluorescence imaging and extracting per-nucleus deformation from 3D+time data using spinning-disk confocal microscopy with an optical flow-based pipeline. This adaptable protocol links nuclear mechanics to invasion. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to van Bodegraven et al. 1

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Concepts associés (26)

Force nucléaire

La force nucléaire, qui s'exerce entre nucléons, est responsable de la liaison des protons et des neutrons dans les noyaux atomiques. Elle peut être interprétée en termes d'échanges de mésons légers, comme les pions. Même si son existence est démontrée depuis les années 1930, les scientifiques n'ont pas réussi à établir une loi permettant de calculer sa valeur à partir de paramètres connus, contrairement aux lois de Coulomb et de Newton.

Membrane nucléaire

thumb|350px L'enveloppe nucléaire, ou membrane nucléaire, est une double membrane biologique délimitant les contours du noyau qui contient l'ADN de la cellule eucaryote. Elle est pourvue de nombreux pores permettant le contrôle des échanges entre le cytoplasme et le nucléoplasme, en particulier les ARN messagers. Cette membrane est constituée par une double bicouche phospholipidique Une bicouche externe en continuité avec les membranes du réticulum endoplasmique. Elle est considérée comme une forme différenciée de ce dernier.

Noyau atomique

vignette|Noyau atomique de l'hélium.Le noyau atomique est la région située au centre d'un atome, constituée de protons et de neutrons (les nucléons). La taille du noyau (de l'ordre du femtomètre, soit ) est environ plus petite que celle de l'atome () et concentre quasiment toute sa masse. Les forces nucléaires qui s'exercent entre les nucléons sont à peu près un million de fois plus grandes que les forces entre les atomes ou les molécules. Les noyaux instables, dits radioactifs, sont ceux d'où s'échappent des neutrons.

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