Publication

Temperature dependence of internucleotide nitrogen-nitrogen scalar couplings in RNA

Geoffrey Bodenhausen, Dominique Früh
2002
Journal Articles

Résumé

The temp. dependence of internucleotide nitrogen-nitrogen scalar couplings 2hJ(N,N) across hydrogen bonds in adenine-uracil (A-U) and guanine-cytosine (G-C) base pairs of the 22 nucleotide RNA oligomer GGCGAAGUCGAAAGAUGGCGCC was studied between 280 and 310 K. The value of 2hJ(N,N) was obsd. to decrease monotonically for all four base pairs with increasing temp. The temp. dependence of 2hJ(N,N) was found to be more pronounced for the A-U base pair than for G-C base pairs. An earlier study of cross-correlation effects at 296 K appeared to indicate a reduced mobility of the A-U base pair, as evidenced by small contributions of chem. shift modulation to relaxation rates. [on SciFinder (R)]

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/19ab2d7a-7c2c-4d62-967a-0a871e875403

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Nucleobase

Nucleobases (nitrogenous bases or simply bases) are nitrogen-containing biological compounds that form nucleosides, which, in turn, are components of nucleotides, with all of these monomers constituting the basic building blocks of nucleic acids. The ability of nucleobases to form base pairs and to stack one upon another leads directly to long-chain helical structures such as ribonucleic acid (RNA) and deoxyribonucleic acid (DNA). Five nucleobases—adenine (A), cytosine (C), guanine (G), thymine (T), and uracil (U)—are called primary or canonical.

Modulation du signal

En télécommunications, le signal transportant une information doit passer par un moyen de transmission entre un émetteur et un récepteur. Le signal est rarement adapté à la transmission directe par le canal de communication choisi, hertzien, filaire, ou optique. La modulation peut être définie comme le processus par lequel le signal est transformé de sa forme originale en une forme adaptée au canal de transmission, par exemple en faisant varier les paramètres d'amplitude et d'argument (phase/fréquence) d'une onde sinusoïdale appelée porteuse.

Paire de bases

vignette|Paire de base GC avec ses 3 liaisons hydrogène intermoléculaires vignette|Paire de base AT avec ses 2 liaisons hydrogène intermoléculaires vignette|Les paires de bases (en gris clair) relient les deux brins de l'ADN (en gris foncé) Une paire de bases () est l'appariement de deux bases nucléiques situées sur deux brins complémentaires d'ADN ou ARN. Cet appariement est effectué par des ponts hydrogène. Il y a quatre types de bases nucléiques : A-T-C-G, ces lettres pour Adénine, Thymine, Cytosine et Guanine.

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