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Séance de cours

Expression des gènes : Introduction et analyse des données

Description

Cette séance de cours introduit le concept de données d'expression génique, couvrant la quantification de l'ARN messager dans les échantillons biologiques, l'analyse du génome et les profils d'expression. Il explore également des études et des outils d'expression génique à grande échelle comme l'Atlas Allen Mouse Brain pour examiner l'expression génique dans le cerveau.

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Biologie

Génétique: Génétique moléculaire

Concepts associés (32)

Gene expression profiling

In the field of molecular biology, gene expression profiling is the measurement of the activity (the expression) of thousands of genes at once, to create a global picture of cellular function. These profiles can, for example, distinguish between cells that are actively dividing, or show how the cells react to a particular treatment. Many experiments of this sort measure an entire genome simultaneously, that is, every gene present in a particular cell. Several transcriptomics technologies can be used to generate the necessary data to analyse.

Régulation de l'expression des gènes

La régulation de l'expression des gènes désigne l'ensemble de mécanismes mis en œuvre pour passer de l'information génétique incluse dans une séquence d'ADN à un produit de gène fonctionnel (ARN ou protéine). Elle a pour effet de moduler, d'augmenter ou de diminuer la quantité des produits de l'expression des gènes (ARN, protéines). Toutes les étapes allant de la séquence d'ADN au produit final peuvent être régulées, que ce soit la transcription, la maturation des ARNm, la traduction des ARNm ou la stabilité des ARNm et protéines.

Expression génétique

L'expression des gènes, encore appelée expression génique ou expression génétique, désigne l'ensemble des processus biochimiques par lesquels l'information héréditaire stockée dans un gène est lue pour aboutir à la fabrication de molécules qui auront un rôle actif dans le fonctionnement cellulaire, comme les protéines ou les ARN. Même si toutes les cellules d'un organisme partagent le même génome, certains gènes ne sont exprimés que dans certaines cellules, à certaines périodes de la vie de l'organisme ou sous certaines conditions.

Analyse en série de l'expression des gènes

L'analyse en série de l'expression des gènes (en anglais, Serial Analysis of Gene Expression ou SAGE) est une technique de biologie moléculaire permettant l'analyse de la population en ARNm d'un échantillon donné (organisme, cellules, tissus, etc.). La méthode originelle a été mise au point, et publiée en 1995, par le du centre d'oncologie de l'université Johns-Hopkins. La méthode SAGE est basée sur l'isolation de séquences spécifiques (étiquettes) de chaque ARN, la production des ADN complémentaires (ADNc) correspondant, la production d'une molécule d'ADN synthétique comportant tous ces ADNc, puis le séquençage de cette molécule.

Acide ribonucléique messager

vignette|Représentation schématique de la synthèse et de la maturation d'un ARN messager dans une cellule eucaryote. L'acide ribonucléique messager, ARN messager, ou ARNm (en anglais, mRNA, pour messenger ribonucleic acid), est une molécule intermédiaire d'acide ribonucléique (ARN), consistant en une copie transitoire d'une portion de l'ADN correspondant à un ou plusieurs gènes d'un organisme biologique. L'ARNm est utilisé comme intermédiaire par les cellules pour la synthèse des protéines.

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Séances de cours associées (30)

Cycle de vie des protéines

Couvre l'expression génique, le cycle de vie des protéines et le code génétique dans les neurosciences.

Analyse des transcriptomes en vrac : analyse du flux de travail et de l'expression génique de l'ARN-seq MOOC: Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Explique la transcriptomique, le flux de travail de l'ARN-seq et l'analyse de l'expression des gènes pour les biomarqueurs de maladies.

Données disponibles sur les atlas du cerveau humain d'Allen

Couvre les données disponibles sur les atlas du cerveau humain Allen, y compris l'analyse de l'expression génétique et l'Atlas BrainSpan.

Génomique : réseaux de régulation des gènes

Explore les réseaux de régulation des gènes, les interactions protéine-ADN et les éléments de régulation en génomique.

Les molécules de la vie : les acides nucléiques

Couvre la structure et les fonctions des acides nucléiques, y compris le stockage de l'information génétique et l'expression des gènes.

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Gene expression profiling

Régulation de l'expression des gènes

Expression génétique

Analyse en série de l'expression des gènes

Acide ribonucléique messager

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