Séance de cours

Conception du circuit protéique

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Description

Cette séance de cours se penche sur la conception de circuits protéiques, en se concentrant sur les progrès récents de la biologie synthétique. L'instructeur discute des questions critiques, des défis et de la recherche en cours dans le domaine, en soulignant l'importance des cellules d'ingénierie pour manipuler et comprendre les fonctions cellulaires. La séance de cours couvre les concepts de détection, de traitement et d'actionnement dans les cellules, explorant la conception de circuits protéiques pour diverses applications, telles que la thérapie cellulaire immunitaire et les usines chimiques. La discussion comprend des exemples d'interactions protéiques modifiées, l'utilisation de protéines d'échafaudage pour la transmission du signal, et le potentiel de la conception de protéines dans la création d'interactions de liaison polyvalentes et spécifiques.

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Concepts associés (32)

Protéine

redresse=1.36|vignette|Représentation d'une protéine, ici deux sous-unités d'une molécule d'hémoglobine. On observe les représentées en couleur, ainsi que deux des quatre molécules d'hème, qui sont les groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. redresse=1.36|vignette|Liaison peptidique –CO–NH– au sein d'un polypeptide. Le motif constitue le squelette de la protéine, tandis que les groupes liés aux sont les chaînes latérales des résidus d'acides aminés.

Interaction protéine-protéine

thumb|upright=1.2|L'inhibiteur de la ribonucléase en forme de fer à cheval (en représentation « fil de fer ») forme une interaction protéine–protéine avec la protéine de la ribonucléase. Les contacts entre les deux protéines sont représentés sous forme de taches colorées. Une Interaction protéine–protéine apparait lorsque deux ou plusieurs protéines se lient entre elles, le plus souvent pour mener à bien leur fonction biologique.

Génie génétique

Le génie génétique est l'ensemble des outils permettant de modifier la constitution génétique d'un organisme en supprimant, en introduisant ou en remplaçant de l'ADN. Celui-ci peut être introduit directement dans les cellules de l'organisme hôte ou dans des cellules cultivées ex vivo puis réintroduites dans l'organisme. Un prérequis au développement du génie génétique a été la mise au point de techniques recombinantes d'acide nucléique pour former de nouvelles combinaisons de matériel génétique héritable suivies de l'incorporation de ce matériel soit indirectement à travers un système vecteur ou directement par microinjection, macroinjection ou microencapsulation.

Synthetic biological circuit

Synthetic biological circuits are an application of synthetic biology where biological parts inside a cell are designed to perform logical functions mimicking those observed in electronic circuits. The applications range from simply inducing production to adding a measurable element, like GFP, to an existing natural biological circuit, to implementing completely new systems of many parts. The goal of synthetic biology is to generate an array of tunable and characterized parts, or modules, with which any desirable synthetic biological circuit can be easily designed and implemented.

Repliement des protéines

thumb|right|300px|Repliement des protéines Le repliement des protéines est le processus physique par lequel un polypeptide se replie dans sa structure tridimensionnelle caractéristique dans laquelle il est fonctionnel. Chaque protéine commence sous forme de polypeptide, transcodée depuis une séquence d'ARNm en une chaîne linéaire d'acides aminés. Ce polypeptide ne possède pas à ce moment de structure tridimensionnelle développée (voir côté gauche de la figure).

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Ingénierie de cellules immunitaires : Inhibiteurs de points de contrôle ciblés

Explore l'ingénierie des cellules immunitaires pour la thérapie contre le cancer, en mettant l'accent sur le ciblage des inhibiteurs de contrôle par des méthodes d'administration novatrices.

Exploration de la structure protéique

Explore la composition, la synthèse, la purification et les techniques d'analyse des protéines pour comprendre la structure et la fonction des protéines.

Production de protéines: Bactéries d'ingénierie pour la synthèse de protéines

Couvre l'ingénierie des bactéries pour des techniques efficaces de production et de purification des protéines à l'aide d'étiquettes d'affinité.

Expression et purification des protéines

Couvre le processus d'expression et de purification des protéines, y compris l'importance d'étudier la fonction des protéines, le repliement, les interactions, la séquence et la structure.

Interaction des protéines Empreintes digitales avec l'apprentissage en profondeur géométrique

Explore le déchiffrage des empreintes digitales de l'interaction protéine-protéine à l'aide d'un apprentissage en profondeur géométrique et les défis de la conception de l'interaction protéine-protéine computationnelle.

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