Séance de cours

Dynamique membranaire: Interactions moléculaires et effet hydrophobe

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Description

Cette séance de cours explore les interactions moléculaires et l'effet hydrophobe dans les membranes biologiques, explorant l'auto-assemblage des protéines et des lipides, le rôle des têtes polaires et des queues hydrophobes, et le formalisme de l'hydrophobicité. L'instructeur explique la fonction de partition, la tension de surface et l'énergie associée à la liaison hydrogène. La séance de cours couvre également l'insertion de molécules non polaires près des molécules d'eau, la division des états et l'impact sur la liaison hydrogène. La discussion s'étend à l'énergie libre des arrangements membranaires, à l'utilisation de pinces à épiler optiques dans les études membranaires et au regroupement dynamique des moteurs dans les membranes.

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Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Biologie cellulaire: Membrane (biologie)

Concepts associés (32)

Dynamique moléculaire

La dynamique moléculaire est une technique de simulation numérique permettant de modéliser l'évolution d'un système de particules au cours du temps. Elle est particulièrement utilisée en sciences des matériaux et pour l'étude des molécules organiques, des protéines, de la matière molle et des macromolécules. En pratique, la dynamique moléculaire consiste à simuler le mouvement d'un ensemble de quelques dizaines à quelques milliers de particules dans un certain environnement (température, pression, champ électromagnétique, conditions aux limites.

Densité surfacique d'énergie

La densité surfacique d'énergie ou énergie surfacique, voire densité énergétique (quand le contexte surfacique est clair), est la quantité d’énergie par une unité de surface. Dans le Système international elle se mesure en J/m (joules par mètre carré). Dans un contexte industriel on l'exprime souvent en kWh/m (kilowatts-heures par mètre carré). Cette grandeur physique est principalement utilisée dans l'étude physique des interfaces entre liquides non miscibles, ou entre liquide et gaz, où elle caractérise l'énergie nécessaire à former une interface d'une certaine surface.

Lipide

redresse=1.33|vignette|Phosphatidylcholine, un phosphoglycéride constitué d'un résidu glycérol (en noir) estérifié par la phosphocholine (en rouge), l'acide palmitique (en bleu) et l'acide oléique (en vert). redresse=1.33|vignette|Représentation schématique de la « tête polaire » 1 et des « queues apolaires » 2 de molécules amphiphiles de phosphoglycérides. redresse=1.33|vignette|Les phospholipides peuvent s'auto-assembler en milieu aqueux pour former des liposomes, des micelles ou des bicouches lipidiques.

Auto-assemblage

L’auto-assemblage, parfois rapproché de l'auto-organisation, désigne les procédés par lesquels un système désorganisé de composants élémentaires s'assemble et s'organise de façon spontanée et autonome, à la suite d'interactions spécifiques et locales entre ces composants. On parle d'auto-assemblage moléculaire lorsque les composants en question sont des molécules, mais l'auto-assemblage s'observe à différentes échelles, des molécules à la formation du système solaire et des galaxies en passant par l'échelle nanométrique.

Outer membrane vesicles

Outer membrane vesicles (OMVs) are vesicles released from the outer membranes of Gram-negative bacteria. While Gram-positive bacteria release vesicles as well those vesicles fall under the broader category of bacterial membrane vesicles (MVs). OMVs were the first MVs to be discovered, and are distinguished from outer inner membrane vesicles (OIMVS), which are gram-negitive baterial vesicles containing portions of both the outer and inner bacterial membrane.

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Séances de cours associées (64)

Minimisation de l'énergie dans les systèmes biologiques: modèles d'équilibre

Couvre les modèles de minimisation de l'énergie dans les systèmes biologiques, en se concentrant sur l'équilibre et les rôles de l'entropie et de l'hydrophobicité.

Lipidation des protéines : localisation et signalisation membranaires

Couvre la lipidation des protéines, la localisation des membranes, les principales classes lipidiques, la modulation de la signalisation et les radeaux lipidiques dans les membranes biologiques.

Collapse des polymères : covolume et énergie libre

Explore l'effondrement des polymères, en mettant l'accent sur le covolume et l'énergie libre dans le processus.

Fluidité membranaire et fonctions protéiques

Couvre la fluidité membranaire, l'impact de la composition lipidique, les fonctions protéiques et l'étude de la mobilité des molécules.

Dynamique membranaire : pores et agrégats

Discute de la dynamique d'auto-assemblage dans les systèmes huileux et lipidiques, en se concentrant sur la croissance globale et la formation de pores dans les bicouches lipidiques.

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Concepts associés (32)

Dynamique moléculaire

Densité surfacique d'énergie

Lipide

Auto-assemblage

Outer membrane vesicles

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