Analyse des données génomiques: technologie de microarray

Cette séance de cours couvre l'application de la technologie de la microarraie dans l'analyse des données génomiques, en mettant l'accent sur Affymetrix GeneChip Probe Arrays. Parmi les sujets abordés, mentionnons la quantification des signaux, la conception de tableaux, l'analyse d'images, les artefacts en micropuces et les techniques de prétraitement des données telles que l'analyse exploratoire et la normalisation des données. L'instructeur explique le processus de mesure de l'expression génique, de correction de l'arrière-plan et de normalisation quantile. Différentes méthodes d'analyse de l'expression différentielle, telles que MAS 5.0, Li-Wong et RMA, sont discutées, ainsi que le compromis entre la variation des biais. Les conclusions d'études comparant diverses méthodes sont présentées, soulignant l'importance de choisir une approche d'analyse appropriée.