Mécanique quantique dans les simulations QM/MM

Cette séance de cours porte sur les principes des simulations QM/MM, en mettant l'accent sur la simulation dynamique des systèmes QMMM, la sélection et le protocole pour les régions QM/MM, et la solution du problème des déversements d'électrons. Il traite également de l'application de simulations QM/MM à des réactions enzymatiques, comme le mécanisme de réaction lysozymique et la réaction ATPase. La séance de cours explique le potentiel de délimitation auxiliaire, la structure des ribozymes et les études théoriques des réactions enzymatiques. De plus, il introduit le code CPMD et son utilisation dans les simulations QM/MM.