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Microscopie à rayons X à balayage : techniques et applications

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Description

Cette séance de cours porte sur les principes et les applications de la microscopie à rayons X de la transmission de balayage (STXM), en mettant l'accent sur la région de la fenêtre d'eau et ses détails expérimentaux. STXM permet une microspectroscopie avec une focalisation serrée, un balayage raster et une combinaison avec XRF et Auger. Il est couramment utilisé dans le régime des rayons X mous pour les technologies des polymères, l'imagerie biologique et la science des sols. La zone de fenêtre d'eau, transparente sous le bord K de l'oxygène, permet l'étude de composés organiques et d'éléments biologiquement pertinents. Les spectres XANES fournissent des informations précieuses pour distinguer l'ADN, l'ARN, l'histone et les protéines. Les détails expérimentaux comprennent les techniques de synchrotron seulement, les exigences en matière de vide et les stratégies d'atténuation de la contamination par le carbone.

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Concepts associés (32)

Science des sols

La science des sols, (soil science en anglais), est l'ensemble des disciplines scientifiques concernant les sols de la surface terrestre. Les deux branches principales de la science des sols sont : la pédologie, qui étudie la formation (pédogenèse) et l'évolution des sols ; l'édaphologie, qui étudie l'influence des sols sur les êtres vivants, particulièrement en tant qu'habitats naturels pour les végétaux (l'agrologie portant plus spécifiquement sur l'étude des seuls sols agricoles).

Histone

Les histones sont des protéines localisées dans le noyau des cellules eucaryotes et dans les archées. Elles sont les principaux constituants protéiques des chromosomes. Elles sont en effet étroitement associées à l’ADN dont elles permettent la compaction, cette action formant des structures appelées nucléosomes : l'ADN est enroulé autour des histones comme du fil autour d'une bobine. Les histones sont très riches en acides aminés basiques (lysine et arginine), dont la charge positive à pH physiologique permet une interaction forte avec les groupements phosphate de l'ADN qui portent des charges négatives.

Agricultural soil science

Agricultural soil science is a branch of soil science that deals with the study of edaphic conditions as they relate to the production of food and fiber. In this context, it is also a constituent of the field of agronomy and is thus also described as soil agronomy. Prior to the development of pedology in the 19th century, agricultural soil science (or edaphology) was the only branch of soil science. The bias of early soil science toward viewing soils only in terms of their agricultural potential continues to define the soil science profession in both academic and popular settings .

Acide ribonucléique

vignette|Structure tridimensionnelle d'un ARN régulateur (riboswitch). vignette|Structure moléculaire de l'ARN. L'acide ribonucléique ou ARN (en anglais, RNA, pour ribonucleic acid) est un acide nucléique présent chez pratiquement tous les êtres vivants, et aussi chez certains virus. L'ARN est très proche chimiquement de l'ADN et il est d'ailleurs en général synthétisé dans les cellules à partir d'un segment d'ADN matrice dont il est une copie.

Histone désacétylase

Une histone désacétylase (abrégé HDAC) est une enzyme catalysant la perte du groupement acétyl sur la queue N-terminale d'une histone. Leur rôle est l'inverse de celui tenu par les histone acétyltransférases. Les histone désacétylases jouent un rôle important dans la régulation de l'expression génétique. thumb|right|(Dés)acétylation d'un histoneVert : chaîne polypeptidiqueBleu : chaine latérale (Lys)Orange : groupement modifiable D'une manière générale, l'intervention des HDAC entraîne une baisse d'expression au niveau des zones concernées du génome.

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Dégradation des matières organiques

Explore la composition et la décomposition de la matière organique dans les sols, soulignant le rôle crucial des microorganismes et la formation de l'humus.

Protéines : Dogme central et traduction

Explique la synthèse des protéines, la traduction et le dogme central de la biologie moléculaire.

Dégradation des matières organiques

Explore la dégradation de la matière organique, le rôle des micro-organismes et la formation de substances humiques dans les sols.

Structure de l'ADN et de l'ARN

Explore la composition et la structure de l'ADN et de l'ARN, y compris la réplication de l'ADN et le code génétique.

L’auto-attraction de l’ADN : interactions médiées

Discute de l'auto-attraction de l'ADN et de ses interactions médiées.

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Histone

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Histone désacétylase

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