Analyse co-évolutionnaire des protéines

Cette séance de cours de l'instructeur couvre l'analyse co-évolutionnaire des séquences protéiques, en mettant l'accent sur la découverte et les orientations futures dans ce domaine. En commençant par une explication des protéines et de leurs fonctions au sein des cellules, la séance de cours se penche sur le processus de pliage, les séquences d'acides aminés et l'état natif. Il explore ensuite le concept de proximité des acides aminés induisant des corrélations, des mutations corrélées et des contacts avec les résidus dans les protéines. La discussion s'étend à l'analyse directe du couplage (ACD), à ses aspects techniques, à la pseudoprobabilité d'ACD, au flux de travail et aux premiers résultats. La séance de cours conclut en soulignant l'importance de la co-évolution dans la prédiction de la structure protéique, les outils de référence comme AlphaFold 2 et l'évaluation critique des techniques de prévision de la structure protéique (CASC).