Mediaspace scheduled maintenance: Aug 25, 2026 07:00 - 12:00 AM. During this time, videos will be temporarily unavailable. Check status updates.

Séance de cours

Éléments logistiques: Mise en œuvre du projet et code fourni

Description

Cette séance de cours couvre les éléments logistiques liés à un mini-projet, y compris les détails d'administration, les objectifs du projet, la mise en oeuvre d'algorithmes et le code fourni. Les élèves travailleront sur l'édition des tableaux, le calcul des scores, la réalisation d'alignements et la recherche d'alignements optimaux à l'aide de l'algorithme Needleman-Wunsch.

Cette vidéo est disponible exclusivement sur Mediaspace pour un public restreint. Veuillez vous connecter à Mediaspace pour y accéder si vous disposez des autorisations nécessaires.

Regarder sur Mediaspace

Source officielle

Concepts associés (16)

Alignement de séquences

En bio-informatique, l'alignement de séquences (ou alignement séquentiel) est une manière de représenter deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes sous les autres, de manière à en faire ressortir les régions homologues ou similaires. L'objectif de l'alignement est de disposer les composants (nucléotides ou acides aminés) pour identifier les zones de concordance. Ces alignements sont réalisés par des programmes informatiques dont l'objectif est de maximiser le nombre de coïncidences entre nucléotides ou acides aminés dans les différentes séquences.

Multiple sequence alignment

Multiple sequence alignment (MSA) may refer to the process or the result of sequence alignment of three or more biological sequences, generally protein, DNA, or RNA. In many cases, the input set of query sequences are assumed to have an evolutionary relationship by which they share a linkage and are descended from a common ancestor. From the resulting MSA, sequence homology can be inferred and phylogenetic analysis can be conducted to assess the sequences' shared evolutionary origins.

Structural alignment

Structural alignment attempts to establish homology between two or more polymer structures based on their shape and three-dimensional conformation. This process is usually applied to protein tertiary structures but can also be used for large RNA molecules. In contrast to simple structural superposition, where at least some equivalent residues of the two structures are known, structural alignment requires no a priori knowledge of equivalent positions.

Gestion de projet

La gestion de projet, est l'ensemble des activités visant à organiser le bon déroulement d’un projet et à en atteindre les objectifs en temps et en heures selon les objectifs visés. Elle consiste à appliquer les méthodes, techniques, et outils de gestion spécifiques aux différentes étapes du projet, de l'évaluation de l'opportunité jusqu'à l'achèvement du projet. Cette activité porte également le nom de conduite de projet, pilotage de projet, ingénierie de projet, ou encore management de projet.

Sequence analysis

In bioinformatics, sequence analysis is the process of subjecting a DNA, RNA or peptide sequence to any of a wide range of analytical methods to understand its features, function, structure, or evolution. Methodologies used include sequence alignment, searches against biological databases, and others. Since the development of methods of high-throughput production of gene and protein sequences, the rate of addition of new sequences to the databases increased very rapidly.

Afficher plus

Séances de cours associées (18)

Calcul de la distance génétique

Explore le calcul de la distance génétique, l'alignement des séquences et l'impact de la friction.

Calcul de la distance génétique

Explore l'alignement des séquences d'ADN, le calcul de la distance génétique et l'impact des alignements incorrects pendant la méiose.

Comprendre les modèles génériques des séquences protéiques

Explore un cadre unifié pour la compréhension et l'évaluation de modèles de séquences génériques d'ADN/ARN ou de protéines, couvrant des sujets tels que la coévolution, la conservation et différents modèles tels que GREMLIN et BERT.

Ergo: chiffres ergométriques

Couvre l'analyse des chiffres d'ergométrie à l'aide d'Excel et l'interprétation des paramètres respiratoires et cardiovasculaires.

Consommation d'oxygène : calculs de validation

Couvre les calculs de validation de la consommation d’oxygène dans Excel.

Afficher plus

Concepts associés (16)

Alignement de séquences

Multiple sequence alignment