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Séance de cours

Données sur le cerveau de la souris de l'Institut Allen

Description

Cette séance de cours couvre les données de la souris Cerveau de Allen Institute, détaillant les processus de collecte et de développement, y compris le format de série pour le multiplexage et l'étude de l'expression génique. Il explore également l'Atlas Allen de référence, le prétraitement des images ISH et l'Atlas Allen de la souris en développement.

Dans MOOC

Les neurosciences reconstruites : Génétique et développement du cerveau

Source officielle

Concepts associés (32)

Brain simulation

Brain simulation is the concept of creating a functioning computer model of a brain or part of a brain. Brain simulation projects intend to contribute to a complete understanding of the brain, and eventually also assist the process of treating and diagnosing brain diseases. Various simulations from around the world have been fully or partially released as open source software, such as C. elegans, and the Blue Brain Project Showcase.

Expression génétique

L'expression des gènes, encore appelée expression génique ou expression génétique, désigne l'ensemble des processus biochimiques par lesquels l'information héréditaire stockée dans un gène est lue pour aboutir à la fabrication de molécules qui auront un rôle actif dans le fonctionnement cellulaire, comme les protéines ou les ARN. Même si toutes les cellules d'un organisme partagent le même génome, certains gènes ne sont exprimés que dans certaines cellules, à certaines périodes de la vie de l'organisme ou sous certaines conditions.

Ontologie (philosophie)

L'ontologie est une branche de la philosophie et plus spécifiquement de la métaphysique qui, dans son sens le plus général, s'interroge sur la signification du mot « être ». est une question considérée comme inaugurale, c'est-à-dire première dans le temps et première dans l'ordre de la connaissance. Elle est celle des premiers penseurs de la Grèce antique, tels Parménide et Platon. Elle déborde très largement le strict cadre de la métaphysique qui, née chez Aristote, étudie les différentes modalités et propriétés de l'être (ne posant déjà plus de problème en soi), avec quoi on a tendance à la confondre.

Upper ontology

In information science, an upper ontology (also known as a top-level ontology, upper model, or foundation ontology) is an ontology (in the sense used in information science) which consists of very general terms (such as "object", "property", "relation") that are common across all domains. An important function of an upper ontology is to support broad semantic interoperability among a large number of domain-specific ontologies by providing a common starting point for the formulation of definitions.

Régulation de l'expression des gènes

La régulation de l'expression des gènes désigne l'ensemble de mécanismes mis en œuvre pour passer de l'information génétique incluse dans une séquence d'ADN à un produit de gène fonctionnel (ARN ou protéine). Elle a pour effet de moduler, d'augmenter ou de diminuer la quantité des produits de l'expression des gènes (ARN, protéines). Toutes les étapes allant de la séquence d'ADN au produit final peuvent être régulées, que ce soit la transcription, la maturation des ARNm, la traduction des ARNm ou la stabilité des ARNm et protéines.

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Séances de cours associées (45)

Neuroinformatique : Ontologies MOOC: Simulation de la neuroscience

Explore le rôle des ontologies dans les neurosciences, en mettant l'accent sur l'organisation des données et la définition des propriétés des entités.

Effectuer une recherche dans l'Atlas Allen du cerveau

Couvre le tutoriel sur l'exécution d'une recherche dans l'Atlas Allen du cerveau, explorant les données d'expression génétique.

Concepts de dépendance et Copulas

Explore les concepts de dépendance, les copules, les corrélations fallacieuses et les corrélations de classement dans les statistiques.

Paradoxe bus rouge/bus bleu

Explore le paradoxe du bus rouge/bus bleu, les modèles de logit imbriqués et les modèles multivariés d'extrême valeur dans le transport.

Quantifier la dépendance statistique: Covariance et corrélation

Explore la covariance, la corrélation et l'information mutuelle dans la quantification de la dépendance statistique entre les variables aléatoires.

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