Séance de cours

Génomique : facteurs de transcription et reprogrammation

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Dans cours

BIO-373: Genetics and genomics

The theoretical part of this course covers classical genetics and contemporary genomics. Because bioinformatics has become important for genomic research, the course also includes practical applications to genomic analyses using Python, including group pro ...

Description

Cette séance de cours couvre la structure et la fonction des réseaux de régulation des gènes, en se concentrant sur le rôle des facteurs de transcription dans la reprogrammation des cellules somatiques en cellules souches pluripotentes induites. Il explique le processus de reprogrammation en utilisant le cocktail Yamanaka de facteurs de transcription et les mécanismes moléculaires impliqués. La séance de cours traite également de l'identification des nœuds de réseau, des sites de liaison des facteurs de transcription et du concept de SMILE-seq pour la découverte de motifs. En outre, il explore la corrélation entre les limites d'expression du gène Hox et les limites morphologiques chez différentes espèces.

Enseignant·e·s (2)

Bart Deplancke

Enseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Wenyu Liu, Théo Nass, Augoustina Maria Economou, Horia Hashimi, Timothée Ferrari, Loïc David, Laurine Cécile Florentine Van Gijn, Angelika Gebhart, Camille Lucie Germaine Lambert, Marie Denise Rumpler, Antoni Jakub Gralak, Elisa Bugani, Geoffray Marie-Devillard A dirigé les thèses EPFL de Jovan Simicevic, Carine Delattre-Gubelmann, Andreas Massouras, Irina Krier, Alina Isakova, Sebastian Martin Waszak, Rachana Narendra Pradhan, Adamandia Kapopoulou, Roel Bevers,

Jacques Fellay

Jacques Fellay is a medical scientist with expertise in infectious diseases and human genomics. He obtained his MD from the University of Lausanne in 2002 and his PhD from University of Utrecht. After a clinical training in infectious diseases in Switzerland and a 4-years postdoctoral fellowship at Duke University, he joined the EPFL in April 2011 with an SNF Professorship. On top of his EPFL affiliation, Jacques is also Head of Precision Medicine at the University Hospital (CHUV) in Lausanne, Group Leader at the Swiss Institute of Bioinformatics, and Co-director of the Health2030 Genome Center at Campus Biotech in Geneva.

Source officielle

Proximité ontologique

Génie biologique

Génie biomédical: Ingénierie tissulaire

Concepts associés (32)

Cellule souche pluripotente induite

Les cellules souches pluripotentes induites (CSPi) (en anglais Induced pluripotent stem cells soit iPS ou iPSCs) sont des cellules souches pluripotentes générées en laboratoire à partir de cellules somatiques. Ces cellules souches induites ont le potentiel de se différencier en n'importe quelle cellule du corps humain et ont donc des applications très variées en thérapie et en recherche biomédicale.

Cellule souche

vignette|Cellules souches embryonnaires de souris en culture. En biologie cellulaire, une cellule souche est une cellule indifférenciée capable, à la fois, de générer des cellules spécialisées par différenciation cellulaire et de se maintenir dans l'organisme par division symétrique ou division asymétrique. Les cellules souches sont présentes chez tous les êtres vivants multicellulaires. Elles jouent un rôle central dans le développement des organismes ainsi que dans le maintien de leur intégrité au cours de la vie.

Induced stem cells

Induced stem cells (iSC) are stem cells derived from somatic, reproductive, pluripotent or other cell types by deliberate epigenetic reprogramming. They are classified as either totipotent (iTC), pluripotent (iPSC) or progenitor (multipotent – iMSC, also called an induced multipotent progenitor cell – iMPC) or unipotent – (iUSC) according to their developmental potential and degree of dedifferentiation. Progenitors are obtained by so-called direct reprogramming or directed differentiation and are also called induced somatic stem cells.

Adult stem cell

Adult stem cells are undifferentiated cells, found throughout the body after development, that multiply by cell division to replenish dying cells and regenerate damaged tissues. Also known as somatic stem cells (from Greek σωματικóς, meaning of the body), they can be found in juvenile, adult animals, and humans, unlike embryonic stem cells. Scientific interest in adult stem cells is centered around two main characteristics.

Cellule souche embryonnaire

Une cellule souche embryonnaire (CSE) est une cellule souche pluripotente issue de la masse cellulaire interne ou de l'épiblaste d’un embryon préimplantatoire au stade de blastocyste. Un embryon humain atteint le stade de blastocyste 4 à 5 jours après la fécondation et consiste en un amas de 50 à 150 cellules (masse cellulaire interne et trophectoderme). L'isolation de la masse cellulaire interne requiert de détruire le blastocyste. Les cellules souches embryonnaires sont une source quasi parfaite pour les greffes et l'ingénierie tissulaire.

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Séances de cours associées (39)

Applications de cellules souches: modèles, thérapie et clonage

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Variation réglementaire et médecine de précision

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Plasticité cellulaire: facteurs de transcription et état de la chromatine

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Cellule souche pluripotente induite

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