Polymorphisme nucléotidique

vignette|La molécule d'ADN 1 diffère de la 2 par un seul nucléotide (polymorphisme C/T). Le polymorphisme nucléotidique (PN, ou polymorphisme d'un seul nucléotide, PSN ; single nucleotide polymorphism, SNP) est, en génétique, la variation (polymorphisme) d'une seule paire de bases du génome entre individus d'une même espèce, ou entre un individu et la séquence de référence de l'espèce. La variation doit être située à un endroit spécifique du génome et apparaître sur une proportion supérieure à 1 % de la population pour être caractérisée comme PSN. Ces variations sont très fréquentes (environ une paire de bases sur mille dans le génome humain). Les PSN représentent 90 % de l'ensemble des variations génétiques humaines, et des PSN avec une fréquence allélique supérieure à 1% sont présents toutes les cent à trois cents paires de bases en moyenne dans le génome humain, où deux PSN sur trois substituent la cytosine avec la thymine. Les PSN peuvent être causes directes de diverses maladies telles que la drépanocytose, la β-thalassémie et la fibrose kystique. Ils jouent aussi un rôle dans la susceptibilité à certaines maladies, leur gravité et la manière dont notre corps répond aux traitements. Par exemple, une seule mutation d'une paire de bases dans le gène Apo E (Apolipoprotéine E) est associée à un risque plus élevé pour la maladie d'Alzheimer. Les PSN peuvent se retrouver n'importe où sur l'ADN : au sein de régions codantes (exon) ou non-codantes de gènes (intron, 3'- et 5'-UTR), ou dans les régions intergéniques (entre les gènes). Les PSN au sein des régions codantes n'entrainent pas nécessairement la modification de la séquence d'acide aminé de la protéine codée grâce à la redondance du code génétique. Les PSN qui se retrouvent dans des régions non-codantes peuvent avoir des conséquences sur l'épissage, la fixation de facteurs de transcription, sur les séquences d'ARN non codant, et d'une manière générale, sur la régulation de l'expression des gènes.