La spectroscopie par transformée de Fourier est une technique de mesure par laquelle les spectres sont collectés sur la base de mesures de la cohérence d'une source radiative, utilisant le domaine temporel ou le domaine spatial des rayonnements électromagnétiques ou autre. Elle peut être appliquée à plusieurs types de spectroscopie dont la spectroscopie optique, la spectroscopie infrarouge (FTIR, FT-NIRS), la résonance magnétique nucléaire (RMN) et l'imagerie spectroscopique à résonance magnétique (MRSI), la spectrométrie de masse et la spectroscopie par résonance paramagnétique électronique.Il existe plusieurs méthodes pour mesurer la cohérence temporelle incluant la spectroscopie par transformée de Fourier. L'expression « spectroscopie par transformée de Fourier » fait référence au fait que dans toutes ces techniques, une transformation de Fourier est requise pour transformer la donnée brute en un spectre réel et est basée sur le théorème de Wiener-Khintchine. Une des tâches fondamentales en spectroscopie est de caractériser le spectre d'une source lumineuse : connaître l'intensité lumineuse pour chaque longueur d'onde. Pour y parvenir, la méthode la plus simple pour mesurer un spectre est de laisser passer la lumière par un monochromateur, un instrument qui sert à bloquer toutes les longueurs d'onde à l'exception d'une longueur d'onde précise et prédéterminée. Donc, c'est seulement l'intensité de cette longueur d'onde qui est mesurée. En changeant les réglages du monochromateur c'est-à-dire en changeant la longueur d'onde qui n'est pas bloquée, on peut mesurer l'intensité lumineuse en fonction de la longueur d'onde pour le spectre en entier. C'est de cette façon que quelques spectroscopes fonctionnent. La spectroscopie par transformée de Fourier est une technique un peu moins intuitive pour recueillir la même information. Plutôt que de laisser passer une seule longueur d'onde jusqu'au détecteur, cette technique laisse passer plusieurs longueurs d'onde différentes en même temps.