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Le Laboratoire de physiologie microbienne et de biorécupération des ressources (MICROBE) de l'EPFL se concentre sur l'étude de la physiologie des microbes pour comprendre les principes fondamentaux des processus microbiens. Leur recherche vise à optimiser l'utilisation des microbes pour la production d'énergie, le nettoyage de l'environnement et l'amélioration de la santé humaine. Parmi les projets en cours, mentionnons l'élaboration de procédés microbiens de réduction du CO2 pour la production de gaz naturel synthétique et d'autres produits précieux, ainsi que l'étude de fonctions complexes des communautés microbiennes pour guider l'ingénierie du microbiome en vue de la récupération des ressources.