Publication

The OPEP protein model: from single molecules, amyloid formation, crowding and hydrodynamics to DNA/RNA systems

Alessandro Barducci
2014
Reviews

Résumé

The OPEP coarse-grained protein model has been applied to a wide range of applications since its first release 15 years ago. The model, which combines energetic and structural accuracy and chemical specificity, allows the study of single protein properties, DNA-RNA complexes, amyloid fibril formation and protein suspensions in a crowded environment. Here we first review the current state of the model and the most exciting applications using advanced conformational sampling methods. We then present the current limitations and a perspective on the ongoing developments.

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/fe3bf8dd-14af-4c64-86be-7a165b3c61bf

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The OPEP protein model: from single molecules, amyloid formation, crowding and hydrodynamics to DNA/RNA systems

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