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Genomic diversity and Population Structure of Ugandan Taurine and Zebuine Cattle Breeds

2015
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Résumé

An extensive sampling of Ugandan cattle was carried out in the course of the European project Nextgen to identify possible associations between genotypes, livestock endemic diseases and environmental variables. As a prior to the GWAS and selection signatures analyses planned within the project, we analyzed the population structure of Ugandan cattle genotyped with both 54K and 800K HD SNP panels in the context of the worldwide cattle genomic diversity.

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Concepts associés (30)

Génétique des populations

La génétique des populations (GDP) est l'étude de la distribution et des changements de la fréquence des versions d'un gène (allèles) dans les populations d'êtres vivants, sous l'influence des « pressions évolutives » (sélection naturelle, dérive génétique, recombinaison, mutation, et migration). Les changements de fréquence des allèles sont un aspect majeur de l'évolution, la fixation de certains allèles conduit à une modification génétique de la population, et l'accumulation de tels changements dans différentes populations peut conduire au processus de spéciation.

Population structure (genetics)

Population structure (also called genetic structure and population stratification) is the presence of a systematic difference in allele frequencies between subpopulations. In a randomly mating (or panmictic) population, allele frequencies are expected to be roughly similar between groups. However, mating tends to be non-random to some degree, causing structure to arise. For example, a barrier like a river can separate two groups of the same species and make it difficult for potential mates to cross; if a mutation occurs, over many generations it can spread and become common in one subpopulation while being completely absent in the other.

Projet (management)

Un projet est — en management d'entreprise — un ensemble finalisé d’activités et d’actions entreprises par une « équipe projet » sous la responsabilité d'un chef de projet dans le but de répondre à un besoin défini par un contrat dans des délais fixés et dans la limite d'une enveloppe budgétaire allouée. Comme exemple de projets célèbres, on peut citer le « projet Manhattan ».

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Annex 58 HTHP - CH - Integration of HTHPs in Swiss Industrial Processes - Summary Report SI/502336

Human-Made Ocean After Oil Extraction

Exploration of socio-ecological continuity project in great Geneva, toward a convergence of the territorial project of biodiversity and ecological continuities