Publication

Symmetrical reconversion: measuring cross-correlation rates with enhanced accuracy

Geoffrey Bodenhausen
2003
Journal Articles

Résumé

A new strategy has been developed to measure cross-correlation rates with much enhanced accuracy. The method relies on the use of four complementary expts. Errors due to pulse miscalibration and to uncontrolled attenuation factors assocd. with relaxation are cancelled out. Problems due to violations of the secular approxn. are greatly alleviated. The method has been applied to the measurement of N/NH (CSA/DD) cross-correlated relaxation rates in human ubiquitin. [on SciFinder (R)]

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/bd5a54ca-a8de-41b3-9e8d-4f9b111f0515

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Geoffrey Bodenhausen
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Concepts associés (6)

Ubiquitine

L'ubiquitine est une protéine de 76 acides aminés servant, elle-même, de marqueur de protéines à éliminer. Elle est ainsi appelée parce qu'elle est localisée dans tous les compartiments subcellulaires de toutes les cellules des organismes, elle est dite ubiquitaire. L'ubiquitination désigne la fixation (covalente, ATP dépendante grâce à une cascade d'enzymes E1, E2, E3) spécifique et régulée d'une ou plusieurs ubiquitines sur une protéine cible (il faut quatre ubiquitines pour qu'une protéine soit dégradée).

Ubiquitine ligase

L’ubiquitine ligase, ou ubiquitine ligase E3, est une ligase qui catalyse la réaction : ATP + ubiquitine + lysine–proteine AMP + diphosphate + N-ubiquityllysine–protéine. Cette enzyme recrute l' E2 chargée en ubiquitine, reconnaît une protéine substrat, et assiste ou catalyse directement le transfert de l'ubiquitine de l'enzyme E2 vers la protéine substrat. L'ubiquitine est liée à un résidu de lysine sur la protéine cible par une liaison isopeptidique.

Ubiquitin-like protein

Ubiquitin-like proteins (UBLs) are a family of small proteins involved in post-translational modification of other proteins in a cell, usually with a regulatory function. The UBL protein family derives its name from the first member of the class to be discovered, ubiquitin (Ub), best known for its role in regulating protein degradation through covalent modification of other proteins. Following the discovery of ubiquitin, many additional evolutionarily related members of the group were described, involving parallel regulatory processes and similar chemistry.

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