Publication

Engineering of zinc finger and MHC motifs to locked-in tertiary folds

1997
Journal Articles

Résumé

The assembly of helical and b-sheet peptide blocks contg. reactive chain ends results in highly branched chain architectures ("locked-in folds") mimicking native tertiary structures. This mol. kit strategy allows to bypass the protein folding problem in protein de novo design and gives access to protein mimetics of high thermo-dynamic stability. The validity of this concept is exemplified for the design and synthesis of locked-in folds mimicking the zinc finger and MHC folding motifs. [on SciFinder (R)]

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1997
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Concepts associés (17)

Repliement des protéines

thumb|right|300px|Repliement des protéines Le repliement des protéines est le processus physique par lequel un polypeptide se replie dans sa structure tridimensionnelle caractéristique dans laquelle il est fonctionnel. Chaque protéine commence sous forme de polypeptide, transcodée depuis une séquence d'ARNm en une chaîne linéaire d'acides aminés. Ce polypeptide ne possède pas à ce moment de structure tridimensionnelle développée (voir côté gauche de la figure).

Protein design

Protein design is the rational design of new protein molecules to design novel activity, behavior, or purpose, and to advance basic understanding of protein function. Proteins can be designed from scratch (de novo design) or by making calculated variants of a known protein structure and its sequence (termed protein redesign). Rational protein design approaches make protein-sequence predictions that will fold to specific structures.

Protein fold class

In molecular biology, protein fold classes are broad categories of protein tertiary structure topology. They describe groups of proteins that share similar amino acid and secondary structure proportions. Each class contains multiple, independent protein superfamilies (i.e. are not necessarily evolutionarily related to one another). Four large classes of protein that are generally agreed upon by the two main structure classification databases (SCOP and CATH).

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BioReason-Pro: Advancing Protein Function Prediction with Multimodal Biological Reasoning

Advancing multiscale simulations with applications to transition metal based compounds in biological systems

Chaperones convert the energy from ATP into the nonequilibrium stabilization of native proteins