Publication

Identification of Spin Diffusion Pathways in Isotopically Labeled Biomolecules

Geoffrey Bodenhausen, Dominique Früh
1999
Journal Articles

Résumé

One-dimensional NOE expts. applicable to labeled macromols. are presented which allow the manipulation of specific spin diffusion pathways and thus unambiguously identify clandestine spins through which the direct NOE is mediated. A treatment of spin diffusion using av. Liouvillian theory is shown to describe adequately these phenomena. Expts. are carried out on an 15N-labeled sample of human ubiquitin. (c) 1999 Academic Press. [on SciFinder (R)]

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/a76171ed-3676-4dd0-b41e-4b3c97758ee2

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Concepts associés (21)

Ubiquitine

L'ubiquitine est une protéine de 76 acides aminés servant, elle-même, de marqueur de protéines à éliminer. Elle est ainsi appelée parce qu'elle est localisée dans tous les compartiments subcellulaires de toutes les cellules des organismes, elle est dite ubiquitaire. L'ubiquitination désigne la fixation (covalente, ATP dépendante grâce à une cascade d'enzymes E1, E2, E3) spécifique et régulée d'une ou plusieurs ubiquitines sur une protéine cible (il faut quatre ubiquitines pour qu'une protéine soit dégradée).

Ubiquitine ligase

L’ubiquitine ligase, ou ubiquitine ligase E3, est une ligase qui catalyse la réaction : ATP + ubiquitine + lysine–proteine AMP + diphosphate + N-ubiquityllysine–protéine. Cette enzyme recrute l' E2 chargée en ubiquitine, reconnaît une protéine substrat, et assiste ou catalyse directement le transfert de l'ubiquitine de l'enzyme E2 vers la protéine substrat. L'ubiquitine est liée à un résidu de lysine sur la protéine cible par une liaison isopeptidique.

Effet Overhauser nucléaire

En spectroscopie RMN, l'effet Overhauser nucléaire décrit une interaction entre deux spins à travers l'espace et non pas à travers les liaisons chimiques comme le couplage scalaire. Cette interaction est limitée à environ 5-6 Å. En anglais, cet effet s'appelle "Nuclear Overhauser Effect", soit NOE. Cet acronyme est souvent utilisé en français sous l'expression "effet NOE". Une des conséquences de la résonance magnétique nucléaire est l'interaction dipôle-dipôle à travers l'espace.

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