Publication

Nanopore Detection of Single Molecule RNAP–DNA Transcription Complex

2012
Journal Articles

Résumé

In the past decade, a number of single-molecule methods have been developed With the aim of investigating single protein and nucleic acid interactions. For the first time we use solid-state nanopore sensing to detect a single E. coli RNAP DNA transcription complex and single E. coli RNAP enzyme. On the basis of their specific conductance translocation signature, we can discriminate and identify between those two types of molecular translocations and translocations of bare DNA. This opens up a new perspectives for investigating transcription processes at the single-molecule level.

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/658c8a96-3674-4876-a47d-d70ca0b0c219

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Transcription (biologie)

En biologie moléculaire, la transcription est la première étape de l'expression génique basée sur l'ADN, au cours de laquelle un segment particulier d'ADN est « copié » en ARN par une enzyme appelée ARN polymérase. Chez les eucaryotes, la transcription se déroule dans le noyau des cellules. Certains types d'ARN appélés « ARN non codants » n'ont pas vocation à être traduits en protéines et peuvent jouer un rôle régulateur ou structurel (par exemple les ARN ribosomiques).

Facteur de transcription

vignette|upright=2.2|Schéma simplifié du mécanisme d'un activateur. Un facteur de transcription est une protéine nécessaire à l'initiation ou à la régulation de la transcription d'un gène dans l'ensemble du vivant (procaryote ou eucaryote). Elle interagit avec l'ADN et l'ARN-polymérase. Il existe une classification complexe des facteurs de transcription. Les facteurs généraux de la transcription, impliqués dans la composition de la machinerie transcriptionnelle basale organisée autour de l'ARN polymérase II.

Nucléoïde

upright=1.5|vignette| Schéma d'une cellule procaryote (à droite) montrant le nucléoïde, par rapport à une cellule eucaryote (à gauche) montrant le noyau. Le nucléoïde est une région irrégulière située à l'intérieur des cellules procaryotes dans laquelle se trouve tout ou presque tout le matériel génétique. À la différence du noyau des cellules eucaryotes, le nucléoïde des cellules procaryotes n'est pas délimité par une membrane nucléaire.

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