Bisulfite sequencingBisulfite sequencing (also known as bisulphite sequencing) is the use of bisulfite treatment of DNA before routine sequencing to determine the pattern of methylation. DNA methylation was the first discovered epigenetic mark, and remains the most studied. In animals it predominantly involves the addition of a methyl group to the carbon-5 position of cytosine residues of the dinucleotide CpG, and is implicated in repression of transcriptional activity.
DNA methylationDNA methylation is a biological process by which methyl groups are added to the DNA molecule. Methylation can change the activity of a DNA segment without changing the sequence. When located in a gene promoter, DNA methylation typically acts to repress gene transcription. In mammals, DNA methylation is essential for normal development and is associated with a number of key processes including genomic imprinting, X-chromosome inactivation, repression of transposable elements, aging, and carcinogenesis.
ÉpigénétiqueL'épigénétique (mot-valise de épigenèse et génétique) est la discipline de la biologie qui étudie la nature des mécanismes modifiant de manière réversible, transmissible (lors des divisions cellulaires) et adaptative l'expression des gènes sans en changer la séquence nucléotidique (ADN). Alors que la génétique correspond à l’étude des gènes, l’épigénétique s’intéresse à une « couche » d’informations complémentaires qui définit comment ces gènes sont susceptibles d'être utilisés par une cellule.
Plante herbacéePlante herbacée (ou herbacée) est un terme désignant au toutes les plantes , ou . Un siècle plus tard, l'Académie française insiste sur l'opposition herbacé - ligneux en précisant que les herbacés sont aussi (ce qui n'empêche pas une plante herbacée d'être également une plante vivace). Il est donc question de et de . Le même dictionnaire académique, dans sa version de 1932, est plus simple : est herbacé . Au , Théophraste consacre à ce qui a été défini comme plante herbacée les de ses Histoire des plantes, traité de botanique (les et traitent des sous-arbrisseaux et des plantes herbacées).
Plante vivacevignette|Certaines plantes vivaces comme ce Cirse se caractérisent par la pérennité de leurs organes végétatifs même l'hiver où apparaît la tige feuillée séchée de l'année précédente. Une plante vivace, ou plante pérenne, est une plante pouvant vivre plusieurs années. Elle subsiste l'hiver sous forme d'organes spécialisés souterrains protégés du froid et chargés en réserve (racines, bulbes, rhizomes).
Réparation de l'ADNright|vignette|Chromosomes montrant de nombreuses lésions. La réparation de l'ADN est un ensemble de processus par lesquels une cellule identifie et corrige les dommages aux molécules d'ADN qui codent son génome. Dans les cellules, l'acide désoxyribonucléique (ADN) est soumis continuellement à des activités métaboliques normales et à des facteurs environnementaux portant atteinte à son intégrité. Ces facteurs environnementaux sont le plus souvent de nature chimique comme les radicaux libres de l'oxygène et les agents alkylants, ou physique, comme les radiations ultraviolettes et les rayonnements ionisants.
Plante ligneusethumb|Troncs d'acajous de Chine (Toona sinensis) à l' en Pennsylvanie. Une plante ligneuse est une plante qui fabrique en grande quantité des lignines, macromolécules organiques donnant à la plante sa solidité, et dont le bois est le principal matériau de structure : en effet, les lignines sont avec la cellulose les constituants essentiels du bois (aussi appelé xylème secondaire), le mot latin lignum et le mot grec ξύλον (xylon) signifiant bois, au sens du matériau).
Vitis viniferaVitis vinifera, la vigne ou vigne cultivée, est une espèce de plantes dicotylédones de la famille des Vitaceae, sous-famille des Vitoideae, originaire d'une région tempérée de l'Ancien Monde allant du Sud-Est de l'Europe au Caucase et à l'Asie centrale, mais désormais cultivée dans tous les continents (à l'exception de l'Antarctique). Ce sont des arbrisseaux sarmenteux, grimpants s'accrochant à leur supports par des vrilles, dont les tiges peuvent atteindre six mètres de long.
Maladievignette|320px|The Sick Girl (en français : La Fille malade) de Michael Ancher La maladie est une altération des fonctions ou de la santé d'un organisme vivant. On parle aussi bien de la maladie, se référant à l'ensemble des altérations de santé, que dune maladie, qui désigne alors une entité particulière caractérisée par des causes, des symptômes, une évolution et des possibilités thérapeutiques propres. Un ou une malade est une personne souffrant d'une maladie, qu'elle soit déterminée ou non.
MéthylationLa méthylation est l'addition d'un groupe méthyle, le phénomène inverse étant la déméthylation. Dans la nature, en conditions anoxiques, des métaux peuvent être méthylés, comme le mercure, généralement à l'interface entre la zone oxygénée et la zone privée d'oxygène, dans le sédiment ou dans la couche d'eau qui est en contact avec un sédiment fin et non oxygéné, ce qui confère de nouvelles propriétés toxicologiques et écotoxicologiques au mercure qui transformé en méthylmercure devient encore plus toxique, plus mobile et plus bioassimilable.
Cycle annuel de la vignevignette|redresse|Grappes de raisin sur un cep de vigne. Le cycle annuel de la vigne est un processus biologique qui se déroule chaque année dans les vignobles. Il commence au printemps par le débourrement des bourgeons et culmine en automne par la chute des feuilles, suivie par la dormance en hiver. Du point de vue de la vinification, chaque étape du processus joue un rôle essentiel dans le développement du raisin pour obtenir des caractéristiques idéales pour la fabrication du vin.
Propagation of grapevinesThe propagation of grapevines is an important consideration in commercial viticulture and winemaking. Grapevines, most of which belong to the Vitis vinifera family, produce one crop of fruit each growing season with a limited life span for individual vines. While some centenarian old vine examples of grape varieties exist, most grapevines are between the ages of 10 and 30 years. As vineyard owners seek to replant their vines, a number of techniques are available which may include planting a new cutting that has been selected by either clonal or mass (massal) selection.
VitisVitis est un genre d'arbustes et arbrisseaux sarmenteux de la famille des Vitaceae. Ce genre rassemble les espèces de plantes désignées collectivement sous le nom vernaculaire « vignes ». Il comporte plus de 72 espèces réparties dans les zones tempérées et subtropicales de l'Europe et du Proche-Orient, d'Asie Orientale et d'Amérique du Nord et Centrale. Parmi les nombreuses espèces du genre, la principale sur le plan économique est la vigne européenne, Vitis vinifera, cultivée un peu partout dans les régions tempérées du monde.
Physiologie végétalethumb|Un laboratoire de phytobiologie en 1901. La physiologie végétale, ou phytobiologie, est la science qui étudie le fonctionnement des organes et des tissus végétaux. Elle cherche à préciser la nature des mécanismes grâce auxquels les organes remplissent leurs fonctions.
Tronc (botanique)En botanique, un tronc est la partie principale de la tige simple d'un arbre ou arbuste, généralement verticale et sans ramification sur une hauteur importante, située entre les racines et le houppier, supporté par les branches maîtresses. Le tronc est constitué de deux parties, le bois, tissu ligneux, au centre, et l'écorce en périphérie. Le tronc occupe la même fonction que les branches, mais les relie aux racines. Sous le couvert de la canopée, les troncs perdent naturellement leurs branches basses en commençant par celles du bas.
Epigenetic clockAn epigenetic clock is a biochemical test that can be used to measure age. The test is based on DNA methylation levels, measuring the accumulation of methyl groups to one's DNA molecules. The strong effects of age on DNA methylation levels have been known since the late 1960s. A vast literature describes sets of CpGs whose DNA methylation levels correlate with age. The first robust demonstration that DNA methylation levels in saliva could generate age predictors with an average accuracy of 5.
Vitis labruscaLa Vigne américaine, Vigne des chats ou Vigne-framboisier (Vitis labrusca), est une espèce d'arbrisseaux sarmenteux de la famille des Vitaceae. Elle est cultivée pour ses fruits en grappes. Ses raisins possèdent un bouquet de bonbon anglais et d'herbe verte coupée, avec un goût foxé. On dit aussi qu'ils renardent. Ses rameaux portent des vrilles continues ou subcontinues, mais jamais régulièrement intermittentes comme les autres Vitis. Elle est originaire d'Amérique du Nord (nord-est des États-Unis et du Canada).
Canopy (grape)In viticulture, the canopy of a grapevine includes the parts of the vine visible aboveground - the trunk, cordon, stems, leaves, flowers, and fruit. The canopy plays a key role in light energy capture via photosynthesis, water use as regulated by transpiration, and microclimate of ripening grapes. Canopy management is an important aspect of viticulture due to its effect on grape yields, quality, vigor, and the prevention of grape diseases. Various viticulture problems, such as uneven grape ripening, sunburn, and frost damage, can be addressed by skillful canopy management.
Tigevignette|Schéma représentatif de l'anatomie d'une plante. 1. Appareil caulinaire (6 : tige, 9 : entre-nœud) 2. Appareil racinaire 3. Collet. vignette|L'observation en microscopie à fluorescence de cette coupe transversale montre les caractéristiques anatomiques d'une tige : organe végétal à symétrie axiale, avec des faisceaux cribro-vasculaires constitués de xylème primaire à différenciation centrifuge (5) et de phloème primaire centripète (6). L’absence de formations secondaires et l'endoderme en U (3) caractérisent une tige de Monocotylédone.
Taille de la vignevignette|Pied de vigne taillé en Guyot simple La taille de la vigne est une opération viticole ayant pour but de limiter la croissance démesurée de la vigne pour régulariser la production des raisins en qualité et en quantité. Elle s'effectue généralement pendant le repos végétatif, en hiver, tout en prenant en compte le risque de gelées. Au début de la civilisation, les hommes se contentaient de cueillir les raisins sur les vignes puis, après l'observation de dégâts provoqués par des animaux sur les rameaux, on s'aperçut vite que les grappes situées sur les parties restantes étaient plus grosses et plus sucrées.
