Publication

Reproducible image-based profiling with Pycytominer

2025

Résumé

Advances in high-throughput microscopy have enabled the rapid acquisition of large numbers of high-content microscopy images. Next, whether by deep learning or classical algorithms, image analysis pipelines commonly produce single-cell features. To process these single cells for downstream applications, we present Pycytominer, a user-friendly, open-source Python package that implements the bioinformatics steps key to image-based profiling. We demonstrate Pycytominer’s usefulness in a machine-learning project to predict nuisance compounds that cause undesirable cell injuries.

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/14c5b6a8-b8f6-4fff-a658-ce75aa86c166

À propos de ce résultat

Cette page est générée automatiquement et peut contenir des informations qui ne sont pas correctes, complètes, à jour ou pertinentes par rapport à votre recherche. Il en va de même pour toutes les autres pages de ce site. Veillez à vérifier les informations auprès des sources officielles de l'EPFL.

Graph Chat

Chattez avec Graph Search

Posez n’importe quelle question sur les cours, conférences, exercices, recherches, actualités, etc. de l’EPFL ou essayez les exemples de questions ci-dessous.

AVERTISSEMENT : Le chatbot Graph n'est pas programmé pour fournir des réponses explicites ou catégoriques à vos questions. Il transforme plutôt vos questions en demandes API qui sont distribuées aux différents services informatiques officiellement administrés par l'EPFL. Son but est uniquement de collecter et de recommander des références pertinentes à des contenus que vous pouvez explorer pour vous aider à répondre à vos questions.

2025

Résumé

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/14c5b6a8-b8f6-4fff-a658-ce75aa86c166

À propos de ce résultat

Concepts associés (32)

Quantum algorithm

In quantum computing, a quantum algorithm is an algorithm which runs on a realistic model of quantum computation, the most commonly used model being the quantum circuit model of computation. A classical (or non-quantum) algorithm is a finite sequence of instructions, or a step-by-step procedure for solving a problem, where each step or instruction can be performed on a classical computer. Similarly, a quantum algorithm is a step-by-step procedure, where each of the steps can be performed on a quantum computer.

Algorithme de Shor

En arithmétique modulaire et en informatique quantique, l’algorithme de Shor est un algorithme quantique conçu par Peter Shor en 1994, qui factorise un entier naturel N en temps O et en espace . Beaucoup de cryptosystèmes à clé publique, tels que le RSA, deviendraient vulnérables si l'algorithme de Shor était un jour implanté dans un calculateur quantique pratique. Un message chiffré avec RSA peut être déchiffré par factorisation de sa clé publique N, qui est le produit de deux nombres premiers.

Quantum algorithm for linear systems of equations

The quantum algorithm for linear systems of equations, also called HHL algorithm, designed by Aram Harrow, Avinatan Hassidim, and Seth Lloyd, is a quantum algorithm published in 2008 for solving linear systems. The algorithm estimates the result of a scalar measurement on the solution vector to a given linear system of equations. The algorithm is one of the main fundamental algorithms expected to provide a speedup over their classical counterparts, along with Shor's factoring algorithm, Grover's search algorithm, and the quantum fourier transform.

Afficher plus

Publications associées (9)

Afficher plus

Reproducible image-based profiling with Pycytominer

Chattez avec Graph Search

FedLiverNet: a federated learning framework for privacy-preserving and efficient liver cancer detection

A dual machine learning framework for the solution of the inverse scattering problem in cylindrical plasmas

On Adversarial Robustness and its Practical Applications