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A Cluster of Evolutionarily Recent KRAB Zinc Finger Proteins Protects Cancer Cells from Replicative Stress–Induced Inflammation

Didier Trono, Priscilla Turelli, Sandra Eloise Kjeldsen, Evaristo Jose Planet Letschert, Filipe Amândio Brandão Sanches Vong Martins, Olga Marie Louise Rosspopoff, Cyril David Son-Tuyên Pulver, Romain Forey, Florian Huber

Heterochromatin loss and genetic instability enhance cancer progression by favoring clonal diversity, yet uncontrolled replicative stress leads to mitotic catastrophe and inflammatory responses that promote immune rejection. KRAB domain-containing zinc fin ...

2024

Artificial intelligence for natural product drug discovery

Philippe Schwaller, Albert Hofstetter, Michael Alexander Skinnider, Florian Huber

Developments in computational omics technologies have provided new means to access the hidden diversity of natural products, unearthing new potential for drug discovery. In parallel, artificial intelligence approaches such as machine learning have led to e ...

Nature Portfolio2023

Integrated proteogenomic deep sequencing and analytics accurately identify non-canonical peptides in tumor immunopeptidomes

Didier Trono, George Coukos, Marion Leleu, Evaristo Jose Planet Letschert, Alexandre Harari, Delphine Yvette L Grun, Markus Müller, Florian Huber, Laia Simo Riudalbas

Efforts to precisely identify tumor human leukocyte antigen (HLA) bound peptides capable of mediating T cell-based tumor rejection still face important challenges. Recent studies suggest that non-canonical tumor-specific HLA peptides derived from annotated ...

Nature Research2020