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Subashika Govindan

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In vivo pulse labeling of isochronic cohorts of cells in the central nervous system using FlashTag

Subashika Govindan

The tracing of neuronal cell lineages is critical to our understanding of cellular diversity in the CNS. This protocol describes a fluorescence birth-dating technique to label, track and isolate isochronic cohorts of newborn cells in the CNS in vivo in mou ...

NATURE PUBLISHING GROUP2018

Dynamic regulation of chromatin accessibility by pluripotency transcription factors across the cell cycle

Bart Deplancke, David Michael Suter, Vincent Roland Julien Gardeux, Cédric Deluz, Torgil Elias Friman, Antonio Carlos Alves Meireles Filho, Subashika Govindan

The pioneer activity of transcription factors allows for opening of inaccessible regulatory elements and has been extensively studied in the context of cellular differentiation and reprogramming. In contrast, the function of pioneer activity in self-renewi ...

2019

Endogenous fluctuations of OCT 4 and SOX 2 bias pluripotent cell fate decisions

David Michael Suter, Cédric Deluz, Andrea Brigitta Alber, Torgil Elias Friman, Subashika Govindan, Daniel Strebinger

SOX2 and OCT4 are pioneer transcription factors playing a key role in embryonic stem (ES) cell self‐renewal and differentiation. How temporal fluctuations in their expression levels bias lineage commitment is unknown. Here, we generated knock‐in reporter f ...

2019