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Unige Anna Laskay

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Proteome Digestion Specificity Analysis for Rational Design of Extended Bottom-up and Middle-down Proteomics Experiments

Yury Tsybin, Kristina Srzentic, Unige Anna Laskay

Mass spectrometry (MS)-based bottom-up proteomics (BUP) is currently the method of choice for large-scale identification and characterization of proteins present in complex samples, such as cell lysates, body fluids, or tissues. Technically, BUP relies on ...

Amer Chemical Soc2013

Practical Considerations for Improving the Productivity of Mass Spectrometry-based Proteomics

Yury Tsybin, Anton Kozhinov, Luca Fornelli, Kristina Srzentic, Unige Anna Laskay

Mass spectrometry (MS) is currently the most sensitive and selective analytical technique for routine peptide and protein structure analysis. Top-down proteomics is based on tandem mass spectrometry (MS/MS) of intact proteins, where multiply charged precur ...

Schweizerische Chemische Gesellschaft2013

Extended Bottom-Up Proteomics with Secreted Aspartic Protease Sap9

Yury Tsybin, Kristina Srzentic, Unige Anna Laskay

We investigate the benefits and experimental feasibility of approaches enabling the shift from short (1.7 kDa on average) peptides in bottom-up proteomics to about twice longer (similar to 3.2 kDa on average) peptides in the so-called extended bottom-up pr ...

Elsevier Science Bv2014