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Damien Lionel Nicolas

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The circadian oscillator analysed at the single-transcript level

Eric Daniel Jacques Durandau, Felix Naef, Jake Yeung, Damien Lionel Nicolas

The circadian clock is an endogenous and self-sustained oscillator that anticipates daily environmental cycles. While rhythmic gene expression of circadian genes is well-described in populations of cells, the single-cell mRNA dynamics of multiple core cloc ...

2021

CAST: An automated segmentation and tracking tool for the analysis of transcriptional kinetics from single-cell time-lapse recordings

Felix Naef, Simon Blanchoud, Damien Lionel Nicolas, Benjamin Zoller, Onur Tidin

Fluorescence and bioluminescence time-lapse imaging allows to investigate a vast range of cellular processes at single-cell or even subcellular resolution. In particular, time-lapse imaging can provide uniquely detailed information on the fine kinetics of ...

Academic Press Inc Elsevier Science2015

What shapes eukaryotic transcriptional bursting?

Felix Naef, Damien Lionel Nicolas, Nicholas Edward Phillips

Isogenic cells in a common environment present a large degree of heterogeneity in gene expression. Part of this variability is attributed to transcriptional bursting: the stochastic activation and inactivation of promoters that leads to the discontinuous p ...

Royal Society of Chemistry2017