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Raphaël Ortiz

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A large number of vision applications rely on matching keypoints across images. The last decade featured an arms-race towards faster and more robust keypoints and association algorithms: Scale Invariant Feature Transform (SIFT), Speed-up Robust Feature (SU ...

Ieee2012

Multimodal characterization of murine gastruloid development

Matthias Lütolf, Alexandre Gauthier Aurèle Mayran, Stefano Davide Vianello, Raphaël Ortiz

Gastruloids are 3D structures generated from pluripotent stem cells recapitulating fundamental principles of embryonic pattern formation. Using single-cell genomic analysis, we provide a resource mapping cell states and types during gastruloid development ...

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Multiscale light-sheet organoid imaging framework

Raphaël Ortiz, Petr Strnad, Andrea Boni

Live imaging of organoid growth remains a challenge: it requires long-term imaging of several samples simultaneously and dedicated analysis pipelines. Here the authors report an experimental and image processing framework to turn long-term light-sheet imag ...

Nature Portfolio2022