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Karolina Bojkowska

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In Vivo Studies on the Control of Gene Expression and Protein Degradation

Karolina Bojkowska

Cellular homeostasis is maintained by tightly regulated gene networks, controlled notably at the levels of transcription, mRNA processing, and protein post-translational modification and turnover. This thesis focuses on two of these regulatory steps, namel ...

EPFL2011

Measuring In Vivo Protein Half-Life

Didier Trono, Kai Johnsson, Christian Heinis, Sandra Eloise Kjeldsen, Sonia Verp, Isabelle Barde, Karolina Bojkowska

Protein turnover critically influences many biological functions, yet methods have been lacking to assess this parameter in vivo. Here, we demonstrate how chemical labeling of SNAP-tag fusion proteins can be exploited to measure the half-life of resident i ...

Elsevier2011

The KRAB-ZFP/KAP1 System Contributes to the Early Embryonic Establishment of Site-Specific DNA Methylation Patterns Maintained during Development

Didier Trono, Priscilla Turelli, Sandra Eloise Kjeldsen, Adamantia Kapopoulou, Charlène Mireille Raymonde Raclot, Karolina Bojkowska

De novo DNA methylation is an essential aspect of the epigenetic reprogramming that takes place during early development, yet factors responsible for its instatement at particular genomic loci are poorly defined. Here, we demonstrate that the KRAB-ZFP-medi ...

Elsevier2012