Stewart ColeProfessor Stewart Cole is an international authority in bacterial molecular-genetics and genomics. He has made outstanding contributions in several fields including: bacterial anaerobic electron transport; genome analysis of retroviruses and papillomaviruses; antibiotic resistance mechanisms; and the molecular microbiology of toxigenic clostridia. His studies on isoniazid and multidrug resistance in Mycobacterium tuberculosis, together with his pioneering work on the pathogenicity, evolution and genomics of the tubercle and leprosy bacilli, have made him an undisputed leader in the field of mycobacterial research. The findings of his research are of direct relevance to public health and disease-control in both the developing world and the industrialised nations. He has published over 250 scientific papers and review articles, and holds many patents.
Didier TronoAprès des études de médecine à l’Université de Genève et une formation clinique en pathologie, médecine interne et maladies infectieuses à Genève et au Massachusetts General Hospital de Boston, Didier Trono s’engage dans une carrière scientifique au Whitehead Institute du MIT. En 1990, il est recruté par le Salk Institute de San Diego pour lancer un centre de recherche sur le SIDA. Il rentre en Europe sept ans plus tard, avant de prendre en 2004 les rênes de la toute nouvelle faculté des Sciences de la Vie de l’EPFL, dont il orchestre le développement et qu’il dirige jusqu’en 2012. Il participe aujourd’hui activement à la coordination des efforts de la Suisse en vue de l’intégration des nouvelles technologies dans le domaine de la médecine de précision et de la santé personnalisée.
Florence PojerExpertise
MER and Head of Unit - Protein Production and Structure Reseach Core Facility within the Life Sciences School - PTPSP: Expertise in Integrative protein Structural Biology (mainly X-ray Crystallography and Cryo-EM) and production of macromolecules in mammalian and bacterial cells. Innovate4Life team member at SV: i4L supports the next generation of entrepreneurs through education, mentorship, and funding, to translate life sciences discoveries into technologies that benefit society.Education and
Giovanna AmbrosiniCurrent Position Senior Scientist, School of Life Sciences, Bioinformatics Competence Center, école Polythechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne.Senior bioinformatician and software engineer with proven experience working in higher education institutions. Solid experience in scientific computing and web design. Proficient in physics and computational genomics, with a focus on high-throughput genomic sequencing data analysis (ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq, scRNA-seq, and exome sequencing) and other types of
Giovanni De MicheliExpertise
Technologies de conception pour les systèmes intégrés, tels que la synthèse, le codesign de HW/SW et la conception de basse puissance. Technologies de conception des systèmes sur les plateformes hétérogènes comprenant les composants électriques, et biologiques.
En savoir plus
Consulter svp http://si2.epfl.ch/~demichel/
Enseignement et PhD A dirigé les thèses EPFL de Abhishek Garg, Mohamed Haykel Ben Jamaa, Francesco Zanini, Ciprian Seiculescu, Cristina Boero, Hu Xu, Andrea Cavallini, Shashi Kanth Rizlan Bernier-LatmaniHIGHER EDUCATION
Summer course: Advances in Genome Technology and Bioinformatics Course at the Marine Biology Laboratory in Woods Hole, MA. October 2005.
Ph.D. 2001 Civil and Environmental Engineering, Stanford University, CA
(Advisor, Jim Leckie, Biodegradation of uranyl (UO22 )-complexed citrate and implications for uranyl mobility in the subsurface)
M.S. 1995 Civil and Environmental Engineering, Stanford University, CA
B.S. 1993 Natural Resources with Honors, Cornell University, Ithaca, NY
PROFESSIONAL EMPLOYMENT
2013-present Associate professor with tenure, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering, Swiss Federal Institute of Technology, Lausanne
2005-2013 Assistant professor tenure track, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering, Swiss Federal Institute of Technology, Lausanne
2001-2005 Post-Graduate Researcher, Scripps Institution of Oceanography, La Jolla, CA (PI: Brad Tebo)
1995-2001 Graduate Research Assistant, Stanford University (Advisor: Jim Leckie)
RESEARCH INTERESTS
Gemicrobiology, metal-bacteria interactions, biological reduction and oxidation of metals, biological nanoparticle formation; Characterization of microbial communities in terrestrial environments; Using genomic, microscopic and spectroscopic tools to understand metal transformations by microorganisms.
ACADEMIC HONORS
Rotary Foundation University Professor grant, 2004.
Swiss National Science Foundation Post-doctoral Fellowship, 2001.
Leon B. Reynolds Memorial Scholarship in the School of Engineering at Stanford University, 1995-96.
Graduated with Honors from Cornell University, 1993.
BIBLIOMETRY
http://www.researcherid.com/rid/E-4398-2011
ResearcherID: E-4398-2011 Vassily HatzimanikatisEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Denis Alain Henri Lucien Joly, Luca Milazzo, David Liaskos, Konrad Lagoda, Omar Keshk, Yigit Sibal, Ioannis Tzegiannakis A dirigé les thèses EPFL de Keng Cher Soh, Julien Racle, Noushin Hadadi, Stefano Andreozzi, Stepan Tymoshenko, Meriç Ataman, Joana Raquel Pinto Vieira, Tiziano Dallavilla, Yves Berset, Anush Chiappino-Pepe, Milenko Tokic, Tuure Eelis Hameri, Jasmin Maria Hafner, Homa Mohammadi Peyhani, Daniel Robert Weilandt, Zhaleh Hosseini, Sofia Tsouka, Mar
Priscilla TurelliPositions
2005-présent: Chercheur, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Laboratoire de virologie et génétique, Suisse.
2001-2004: Chercheur dans le laboratoire du Pr D. Trono, Département de Microbiologie, Ecole de Médecine de Genève, Suisse.
1997-2001: Etudiante Post-doctorante dans le laboratoire du Pr D. Trono, Département de Microbiologie, Ecole de Médecine de Genève, Suisse.
Honneurs et prix
2004: Bristol-Myers Squibb AIDS AWARD
1997-1999: Human Frontier Science Program fellowship
Education
June 1997:
PhD in cellular biology.
Final mark:jury congratulations.
Université de la Méditerranée, France.
June 1993:
Post-graduate diploma in cellular biology and microbiology.
INSERM U372, Marseille-Luminy, université de Provence, France.
June 1992:
Master in cellular biology Specialty: genetic.
Final mark: Best master student of this year.
Université de la Méditerranée, France.
June 1987:
Scientific baccalaureate, France.
Enseignement
2009-présent: co-directeur de thèses, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, Suisse
2002: Tuteur en virologie pour les étudiants de médecine, Ecole de Médecine de Genève, Suisse.
1996-1997: Tuteur en biologie moléculaire et biochimie, Université de la Méditerranée, Aix Marseille II Christian HeinisEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Thomas Julien Denis Emel, Alessandro Scapozza, Nathan Moïse De Sadeleer, Florian Handel, Hugo André Clerc, Frédéric Brantschen, Grégoire Menoud, Ines Michrafy, Jonathan Schmitt, Laura Elena Massaad A dirigé les thèses EPFL de Jeremy Touati, Shiyu Chen, Sophie Venet-Bonnot, Lisa Pollaro, Inmaculada Rentero Rebollo, Philippe Diderich, Charlotte Urech-Varenne, Silvia Bellotto, Davide Bertoldo, Alessandro Zorzi, Camille Villequey, Jonas Alfred Karl Wilbs, Grigory Ka
Aleksandra RadenovicEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Helena Miljkovic, Akhil Sai Naidu, Karl Rufus Pang Yeo, Wei Guo, Eveline Simone Mayner, Nianduo Cai, Marianna Mitsioni A dirigé les thèses EPFL de Paolo Annibale, Camille Alice Raillon, Fabrizia Dutto, Arun Shivanandan, Metin Kayci, Jiandong Feng, Roman Bulushev, Michael Graf, Adrien Charles Descloux, Sebastian James Davis, Martina Lihter, Evgenii Glushkov, Vytautas Navikas, Arielle Louise Planchette, Michal Daniel Macha, Mukeshchand Thakur, Nathan Ronceray, Kha
Demetri PsaltisEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Victoria Fay, Colin Nikhil Christian A dirigé les thèses EPFL de Wuzhou Song, Alexandre Goy, Julien Cuennet, Ioannis Papadopoulos, Xin Yang, Grégoire Pierre Jean Laporte, Thomas Jean Victor Marie Lanvin, Seyyed Mohammad Hosseini Hashemi, Nicolino Stasio, Morteza Hasani Shoreh, Marilisa Romito, Pooria Hadikhani, Eirini Kakkava, Joowon Lim, Giulia Panusa, Ahmed Bassam Sayed Ayoub Mohamed Ayoub, Amirhossein Saba, Niyazi Ulas Dinç A co-dirigé les thèses EPFL de Ugur
Johan AuwerxEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Wenyu Liu, Maria Boulougouri, Giacomo Vincenzo Giorgio Von Alvensleben A dirigé les thèses EPFL de Pénélope Andreux, Mitsunori Nomura, Evan Graehl Williams, Hongbo Zhang, Virginija Jovaisaite, Elena Katsyuba, Karim Laurent Gariani, Adrienne Joëlle Laurence Mottis, Hao Li, Peiling Luan, Alexis Bachmann, Mario Romani, Xiaoxu Li, Alessia De Masi, Amélia Lalou A co-dirigé les thèses EPFL de Serge Thanh Son Ducommun, Laura Lukjanenko, Joanna Ratajczak, Angélique Sato
Jacques RougemontEnseignement et PhD A co-dirigé les thèses EPFL de Swapna Uplekar, Irina Krier, Alexis Rapin, Aline Sondra Adler, Teresa Didonna Cours Genomics and bioinformatics BIO-463 Ce cours introduit différentes méthodes d'analyse de données issues du séquencage d'ADN, de l'assemblage de génomes à l'analyse quantitative de l'évolution et de l'expression des gènes, à la liaison des facteurs de transcription et à la conformation des chromosomes.
Bart DeplanckeEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Wenyu Liu, Théo Nass, Augoustina Maria Economou, Horia Hashimi, Timothée Ferrari, Loïc David, Laurine Cécile Florentine Van Gijn, Angelika Gebhart, Camille Lucie Germaine Lambert, Marie Denise Rumpler, Antoni Jakub Gralak, Elisa Bugani, Geoffray Marie-Devillard A dirigé les thèses EPFL de Jovan Simicevic, Carine Delattre-Gubelmann, Andreas Massouras, Irina Krier, Alina Isakova, Sebastian Martin Waszak, Rachana Narendra Pradhan, Adamandia Kapopoulou, Roel Bevers,
Sandro CarraraSandro Carrara a été nommé IEEE Fellow pour ses remarquables réalisations dans le domaine de la conception de biocapteurs CMOS à l'échelle nanométrique. Il a également reçu le prix "IEEE Sensors Council Technical Achievement Award" en 2016 pour son leadership dans le domaine émergent du co-design des interfaces Bio/Nano/CMOS. Il est un Professeur titulaire à l' EPFL à Lausanne (Suisse) et responsable du groupe de recherche "Bio/CMOS Interfaces" (BCI). Il est ancien professeur de biocapteurs optiques et électriques au Département de génie électrique et de biophysique (DIBE) de l'Université de Gênes (Italie) et ancien professeur de nanotechnologie à l'Université de Bologne (Italie). Il est titulaire d'un doctorat en biochimie et de biophysique de l'Université de Padoue (Italie), une master en physique de l'Université de Gênes (Italie), et un diplôme en électronique de l'Institut National de Technologie à Albenga (Italie). Ses intérêts scientifiques sont sur les phénomènes électriques de films nano-bio-structuré, et comprennent CMOS conception de biopuces à base de protéines et de l'ADN. Le long de sa carrière, il a publié 7 livres, l'un comme auteur avec Springer sur les interfaces Bio/CMOS et, plus récemment, un manuel de bioélectronique avec La prestigieuse Cambridge University Press. Il a également publié plus de 250 articles scientifiques et est l'auteur de 13 brevets. Il est maintenant chef rédacteur du Journal IEEE Sensors; il est également fondateur et chef rédacteur du Journal BioNanoScience par Springer, et rédacteur adjoint de IEEE Transactions on Circuits and Biomedical Systems. Il est membre du IEEE Sensors Council et de son comité exécutif. Il était membre du Conseil des gouverneurs de la IEEE Circuits And Systems Society (CASS). Il a été nommé IEEE conférencier émérite pour les années 2017-2019 pour le Conseil IEEE Sensors, et de la société CASS pour les années 2013-2014. Son travail a reçu plusieurs reconnaissances internationales: plusieurs Top-25 Hottest-articles (2004, 2005, 2008, 2009, et deux fois en 2012) publiés dans des journaux internationales très fort impact telles que Biosensors and Bioelectronics, Sensors And Actuators B, IEEE Sensors, et Thin Solid Films; un Award à une conference de l'OTAN en 1996 pour la contribution originale à la physique de la conductivité à électron unique dans les nano-particules; six "Best Paper Awards" pour des articles présentés à la conférence IEEE Sensors Conference en 2019 (Montreal), IEEE NGCAS en 2017 (Genoa), MOBIHEALTH en 2016 (Milan), IEEE PRIME en 2015 (Glasgow), en 2010 (Berlin) et en 2009 (Cork), un prix de la meilleure affiche au rencontre annuel de Nanotera en 2011 (Berne), et un prix de la meilleure affiche au NanoEurope Symposium en 2009 (Rapperswil). De 1997 à 2000, il a été membre d'un comité international au ELETTRA Synchrotron à Trieste. De 2000 à 2003, il était responsable scientifique d'un Programme national de recherche (PNR) dans le dépôt de nanobiotechnologie. Il était un expert internationalement estimé du comité d'évaluation de l'Académie de Finlande dans un programme de recherche pour les années 2010-2013. Il a été le président général (General Chair) de la Conférence IEEE BioCAS 2014, le premier conférence internationale dans le domaine des circuits et des systèmes pour les applications biomédicales.
Raphaelle LuisierEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Lisa Mathilde Julia Fournier, Elisa Messori Cours Genomics and bioinformatics BIO-463 Ce cours introduit différentes méthodes d'analyse de données issues du séquencage d'ADN, de l'assemblage de génomes à l'analyse quantitative de l'évolution et de l'expression des gènes, à la liaison des facteurs de transcription et à la conformation des chromosomes.
Matteo Dal PeraroEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Verena Rukes, Parth Bibekar, Arthur Samurkas, Fernando Augusto Teixeira Pinto Meireles, Benedikt Singer, Artemiy Burov, Ekaterina Pyatova, Edoardo Cavani, Alissa Agerova, Marianna Mitsioni, Jana Susanne Anton, Roxana Ghasemi A dirigé les thèses EPFL de Matteo Thomas Degiacomi, Thomas Lemmin, Enrico Spiga, Christophe Bovigny, Hasan Pezeshgi Modarres, Martina Audagnotto, Giorgio Elikem Tamo, Alexandra Styliani Kalantzi, Deniz Aydin, Giulia Fonti, Alessio Prunotto,
Sebastian MaerklEnseignement et PhD Doctorant·es actuel·les Amogh Kumar Baranwal, Pao-Wan Lee, Seyed Saeed Mottaghi, Onur Burak Özdemir, Mengting Lyu A dirigé les thèses EPFL de Nicolas Dénervaud, Sylvie Rockel, Jean-Bernard Nobs, Arun Stephen Rajkumar, Henrike Marie Niederholtmeyer, Matthew Christopher Blackburn, Kristina Pan Woodruff, Francesca Volpetti, Ekaterina Emilova Petrova, Zoe Newell Swank, Ivan Istomin, Grégoire Michielin, Fabien Jammes, Barbora Lavickova, Hon Ming Andrew Yip, Amir Shahein, Shiyu Cheng, Laura
