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Segmentation of diffusion weighted MRI using the level set framework

Lisa Jonasson

Medical imaging is a rapidly growing field in which diffusion imaging is a recently developed modality. This novel imaging contrast permits in-vivo measurement of the diffusion of water molecules. This is particularly interesting in brain imaging where the ...

EPFL2005

Understanding Diffusion MR Imaging Techniques: From Scalar Diffusion-weighted Imaging to Diffusion Tensor Imaging and Beyond

Jean-Philippe Thiran, Reto Meuli, Patric Hagmann, Lisa Jonasson

The complex structural organization of the white matter of the brain can be depicted in vivo in great detail with advanced diffusion magnetic resonance (MR) imaging schemes. Diffusion MR imaging techniques are increasingly varied, from the simplest and mos ...

2006

White matter fiber tract segmentation in DT-MRI using geometric flows

Jean-Philippe Thiran, Reto Meuli, Patric Hagmann, Xavier Bresson, Olivier Cuisenaire, Lisa Jonasson

In this paper, we present a 3D geometric flow designed to segment the main core of fiber tracts in diffusion tensor magnetic resonance images. The fundamental assumption of our fiber segmentation technique is that adjacent voxels in a tract have similar pr ...

2005