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Séance de cours

Outils de biologie chimique : Interrogation de Transcriptome

Dans cours

CH-313: Chemical biology

Chemical Biology is an interdisciplinary field using chemical principles and techniques to analyse and manipulate biological systems. It relies on small-molecule chemicals to gain an in-depth understanding of biology, and provides new tools and products ra ...

Description

Cette séance de cours introduit des outils de biologie chimique pour étudier les ARN dans les systèmes vivants, couvrant des techniques comme BrdU, les sondes d'épinards et PAR-CLIP. Il explore également le GFP primé par le prix Nobel et ses applications en biosciences.

Enseignant·e·s (2)

Rudolf Hovius

Yimon Aye

Source officielle

Proximité ontologique

Biologie

Génétique: Génétique moléculaire

Concepts associés (32)

Protéine fluorescente verte

vignette|Aequorea victoria. La protéine fluorescente verte (souvent abrégé GFP, de l'anglais « Green Fluorescent Protein ») est une protéine ayant la propriété d'émettre une fluorescence de couleur verte. Issue d'une méduse (Aequorea victoria), cette protéine est intrinsèquement fluorescente sous l'action d'une enzyme, l'aequoréine, une luciférase qui agit en présence de calcium. Son gène peut être fusionné in-vitro au gène d'une protéine que l'on souhaite étudier.

Acide ribonucléique

vignette|Structure tridimensionnelle d'un ARN régulateur (riboswitch). vignette|Structure moléculaire de l'ARN. L'acide ribonucléique ou ARN (en anglais, RNA, pour ribonucleic acid) est un acide nucléique présent chez pratiquement tous les êtres vivants, et aussi chez certains virus. L'ARN est très proche chimiquement de l'ADN et il est d'ailleurs en général synthétisé dans les cellules à partir d'un segment d'ADN matrice dont il est une copie.

Sonde fluorescente

vignette|Utilisation de sondes fluorescentes pour être capable de visualiser des structures qui sont, en temps normal, invisibles de par leur taille. Cellules endothéliales vues au microscope. En bleu, noyaux marqués au DAPI. En vert, microtubules marqués par un anticorps couplé à un fluorochrome. En rouge, actine marquée à la phalloïdine. Une sonde fluorescente est une molécule fluorescente que l'on ajoute à un milieu (cellule ou monocouche, par exemple) pour mettre en évidence certaines zones et/ou pour étudier les propriétés physiques d'un milieu.

Acide ribonucléique ribosomique

vignette|Structure atomique de la grande sous-unité 50S des ribosomes de procaryotes.Les protéines sont colorées en bleu et les ARN en orange. Le site actif, l'adénine 2486 est coloré en rouge L'ARN ribosomique (ARNr) ou ARN ribosomal par anglicisme (ribosomal RNA, rRNA, en anglais) est le constituant principal des ribosomes, auxquels il donne leur nom. Les différents ARNr sont à la fois l'ossature et le cœur du ribosome, un complexe ribonucléoprotéique (composé de protéines et d'ARN) servant à la traduction de l'information génétique codée sur un ARN messager (ARNm).

Interférence par ARN

Un ARN interférent est un acide ribonucléique (ARN) simple ou double brin dont l'interférence avec un ARN messager spécifique conduit à sa dégradation et à la diminution de sa traduction en protéine. Dans la mesure où l'ARN joue un rôle crucial dans l'expression des gènes, l'ARN interférent permet de bloquer celle-ci en rendant « silencieux » tel ou tel gène. Ce phénomène a été découvert dans les années 1990, valant à Andrew Z. Fire et Craig C. Mello le prix Nobel de physiologie et de médecine en 2006.

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Séances de cours associées (31)

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Se penche sur le métabolisme de l'ARN dans la génétique de la SLA, en se concentrant sur les protéines clés, les mutations et les implications dans la neurodégénérescence.

Outils pour l'analyse de la traduction

Explore les outils pour étudier le translatome, y compris la traduction de l'ARNm et l'expansion du code génétique.

Outils de biologie chimique : Interrogation du génome

Explore les outils de biologie chimique pour l'interrogation du génome, couvrant le dogme central, les phases du cycle cellulaire, les nucléosides et les outils de biologie chimique.

Sondes basées sur l'ARN: Engineering GFP-mimics

Explore les sondes basées sur l'ARN, en mettant l'accent sur les mimiques GFP d'ingénierie pour le suivi de l'ARN, en discutant de la maturation chromophore, de l'évolution des épinards et des considérations de liaison.

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Concepts associés (32)

Protéine fluorescente verte

Acide ribonucléique

Sonde fluorescente

Acide ribonucléique ribosomique

Interférence par ARN

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